30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4147 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4147  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  906    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3701  hypothetical protein  40.13 
 
 		 428 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4022  hypothetical protein  38.64 
 
 		 416 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483809  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2968  hypothetical protein  44.26 
 
 		 462 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3200  putative phage tail protein  31.08 
 
 		 478 aa  154  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1885  hypothetical protein  33.43 
 
 		 458 aa  136  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1813  hypothetical protein  34.04 
 
 		 458 aa  132  9e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0977  hypothetical protein  33.73 
 
 		 452 aa  120  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0063  hypothetical protein  33.01 
 
 		 478 aa  100  5e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1351  hypothetical protein  30.77 
 
 		 431 aa  84  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144812 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.82 
 
 		 734 aa  72.4  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4535  hypothetical protein  27.57 
 
 		 699 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3417  hypothetical protein  25.22 
 
 		 475 aa  66.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0473  hypothetical protein  28.44 
 
 		 496 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.926396 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0734  hypothetical protein  25.27 
 
 		 768 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4469  hypothetical protein  31.62 
 
 		 669 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0564  hypothetical protein  25.98 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0748  hypothetical protein  25.55 
 
 		 762 aa  57  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0048  hypothetical protein  26.82 
 
 		 463 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0120  hypothetical protein  26.67 
 
 		 313 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.954008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0468  hypothetical protein  31.16 
 
 		 479 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.252316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0707  hypothetical protein  23.32 
 
 		 776 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1189  hypothetical protein  26.49 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.826438 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1559  hypothetical protein  28.28 
 
 		 425 aa  47.4  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0258  hypothetical protein  30.88 
 
 		 469 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140181  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0287  hypothetical protein  30.34 
 
 		 432 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0313  hypothetical protein  28.26 
 
 		 476 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2912  hypothetical protein  29.85 
 
 		 429 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0303561  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2827  hypothetical protein  27.84 
 
 		 439 aa  43.1  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05310  mitochondrion protein, putative  33.56 
 
 		 725 aa  43.1  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>