17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1559 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1559  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  806    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1189  hypothetical protein  32.02 
 
 		 444 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.826438 
 
 
-
 
NC_004310  BR1885  hypothetical protein  28.57 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0977  hypothetical protein  30.29 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0287  hypothetical protein  36.59 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1813  hypothetical protein  28.57 
 
 		 458 aa  68.2  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0564  hypothetical protein  31.35 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0473  hypothetical protein  31.47 
 
 		 496 aa  63.2  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.926396 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0313  hypothetical protein  31.93 
 
 		 476 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4147  hypothetical protein  26.1 
 
 		 461 aa  50.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0048  hypothetical protein  30.56 
 
 		 463 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3200  putative phage tail protein  25.59 
 
 		 478 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0468  hypothetical protein  28.22 
 
 		 479 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.252316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0707  hypothetical protein  29.86 
 
 		 776 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2968  hypothetical protein  25.78 
 
 		 462 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0258  hypothetical protein  28.92 
 
 		 469 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140181  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1351  hypothetical protein  29.33 
 
 		 431 aa  43.9  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>