14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0258 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0258  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  887    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140181  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0468  hypothetical protein  48.15 
 
 		 479 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.252316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0313  hypothetical protein  46.85 
 
 		 476 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0048  hypothetical protein  46.3 
 
 		 463 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0287  hypothetical protein  42.43 
 
 		 432 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0564  hypothetical protein  42.9 
 
 		 446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0473  hypothetical protein  42.99 
 
 		 496 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.926396 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3200  putative phage tail protein  34.84 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3701  hypothetical protein  30.42 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4147  hypothetical protein  30 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1351  hypothetical protein  31.51 
 
 		 431 aa  54.3  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144812 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4022  hypothetical protein  33.14 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483809  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1189  hypothetical protein  26.37 
 
 		 444 aa  49.3  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.826438 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0977  hypothetical protein  29.73 
 
 		 452 aa  44.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>