23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4022 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4022  hypothetical protein  100 
 
 
416 aa  815    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483809  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3701  hypothetical protein  78.95 
 
 
428 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4147  hypothetical protein  39.23 
 
 
461 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2968  hypothetical protein  40.54 
 
 
462 aa  239  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3200  putative phage tail protein  31.01 
 
 
478 aa  179  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1813  hypothetical protein  32.58 
 
 
458 aa  156  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1885  hypothetical protein  32.58 
 
 
458 aa  156  8e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0977  hypothetical protein  34.32 
 
 
452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1351  hypothetical protein  40.82 
 
 
431 aa  91.3  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.144812 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0063  hypothetical protein  30.85 
 
 
478 aa  87  5e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0564  hypothetical protein  29.2 
 
 
446 aa  74.7  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.05 
 
 
734 aa  67  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0120  hypothetical protein  27.61 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.954008  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0473  hypothetical protein  27.05 
 
 
496 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.926396 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0048  hypothetical protein  27.36 
 
 
463 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0258  hypothetical protein  33.14 
 
 
469 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140181  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0159  hypothetical protein  32.89 
 
 
433 aa  50.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.53716  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6207  hypothetical protein  31.36 
 
 
433 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143416  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4535  hypothetical protein  28.01 
 
 
699 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2912  hypothetical protein  30.43 
 
 
429 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0303561  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0287  hypothetical protein  43.75 
 
 
432 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0734  hypothetical protein  25 
 
 
768 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4469  hypothetical protein  28.41 
 
 
669 aa  43.5  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>