20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4535 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4535  hypothetical protein  100 
 
 
699 aa  1261    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4469  hypothetical protein  72.51 
 
 
669 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0734  hypothetical protein  38.42 
 
 
768 aa  226  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0748  hypothetical protein  38.99 
 
 
762 aa  211  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0707  hypothetical protein  44.38 
 
 
776 aa  210  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579988  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2071  hypothetical protein  40.37 
 
 
728 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0802327 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4147  hypothetical protein  27.82 
 
 
461 aa  76.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3200  putative phage tail protein  29.05 
 
 
478 aa  72.8  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  32.08 
 
 
2449 aa  73.2  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0564  hypothetical protein  29.52 
 
 
446 aa  54.7  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2968  hypothetical protein  29.63 
 
 
462 aa  54.7  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3701  hypothetical protein  26.48 
 
 
428 aa  54.3  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0120  hypothetical protein  32.41 
 
 
313 aa  51.6  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.954008  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1885  hypothetical protein  25.1 
 
 
458 aa  50.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0287  hypothetical protein  29.79 
 
 
432 aa  49.7  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1813  hypothetical protein  24.6 
 
 
458 aa  48.9  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1351  hypothetical protein  34.23 
 
 
431 aa  48.1  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.144812 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1614  Chromosome segregation ATPase-like protein  30.31 
 
 
1235 aa  46.2  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0468  hypothetical protein  32.02 
 
 
479 aa  45.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.252316 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0473  hypothetical protein  24.85 
 
 
496 aa  44.7  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.926396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>