26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3701 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3701  hypothetical protein  100 
 
 
428 aa  834    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4022  hypothetical protein  82.6 
 
 
416 aa  597  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483809  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4147  hypothetical protein  40.63 
 
 
461 aa  279  8e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2968  hypothetical protein  46.08 
 
 
462 aa  229  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3200  putative phage tail protein  32.63 
 
 
478 aa  186  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1813  hypothetical protein  35.17 
 
 
458 aa  151  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1885  hypothetical protein  35.17 
 
 
458 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0977  hypothetical protein  32.22 
 
 
452 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1351  hypothetical protein  41.5 
 
 
431 aa  94  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.144812 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0063  hypothetical protein  30.62 
 
 
478 aa  89.7  8e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0564  hypothetical protein  28.46 
 
 
446 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.27 
 
 
734 aa  69.3  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0120  hypothetical protein  28.36 
 
 
313 aa  60.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.954008  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0258  hypothetical protein  35.75 
 
 
469 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140181  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0473  hypothetical protein  25.99 
 
 
496 aa  53.9  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.926396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4535  hypothetical protein  27.76 
 
 
699 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0159  hypothetical protein  31.82 
 
 
433 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.53716  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6207  hypothetical protein  31.82 
 
 
433 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143416  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0048  hypothetical protein  26.42 
 
 
463 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3417  hypothetical protein  26.88 
 
 
475 aa  50.1  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2912  hypothetical protein  30.43 
 
 
429 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0303561  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0707  hypothetical protein  29.21 
 
 
776 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579988  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0287  hypothetical protein  40.43 
 
 
432 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0313  hypothetical protein  29.29 
 
 
476 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1559  hypothetical protein  22.6 
 
 
425 aa  43.5  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0734  hypothetical protein  25.41 
 
 
768 aa  43.1  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>