20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0287 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0287  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  809    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0564  hypothetical protein  46.89 
 
 		 446 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0048  hypothetical protein  46.6 
 
 		 463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0473  hypothetical protein  40 
 
 		 496 aa  190  5e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.926396 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0468  hypothetical protein  41.43 
 
 		 479 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.252316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0258  hypothetical protein  41.88 
 
 		 469 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140181  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0313  hypothetical protein  53.14 
 
 		 476 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3200  putative phage tail protein  28.47 
 
 		 478 aa  83.2  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1559  hypothetical protein  36.59 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4147  hypothetical protein  27.27 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0977  hypothetical protein  26.1 
 
 		 452 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1885  hypothetical protein  25.89 
 
 		 458 aa  53.9  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1813  hypothetical protein  27.08 
 
 		 458 aa  53.9  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1189  hypothetical protein  25.67 
 
 		 444 aa  53.1  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.826438 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0734  hypothetical protein  29.44 
 
 		 768 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06340  Kinesin-like protein klpA [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P28739]  34.74 
 
 		 770 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0707  hypothetical protein  32.89 
 
 		 776 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0748  hypothetical protein  29.44 
 
 		 762 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4022  hypothetical protein  28.63 
 
 		 416 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483809  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3701  hypothetical protein  28.63 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>