16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1189 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1189  hypothetical protein  100 
 
 
444 aa  870    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.826438 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1559  hypothetical protein  39.72 
 
 
425 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4147  hypothetical protein  27.59 
 
 
461 aa  57.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0063  hypothetical protein  31.69 
 
 
478 aa  57  0.0000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0977  hypothetical protein  28.72 
 
 
452 aa  52.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3701  hypothetical protein  28.99 
 
 
428 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1885  hypothetical protein  24.11 
 
 
458 aa  49.3  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3200  putative phage tail protein  27.81 
 
 
478 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0734  hypothetical protein  32.18 
 
 
768 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1813  hypothetical protein  23.97 
 
 
458 aa  47.8  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0473  hypothetical protein  25.89 
 
 
496 aa  47  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.926396 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0564  hypothetical protein  29.82 
 
 
446 aa  47  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0287  hypothetical protein  25.63 
 
 
432 aa  46.6  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0048  hypothetical protein  26.67 
 
 
463 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4022  hypothetical protein  28.68 
 
 
416 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483809  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2968  hypothetical protein  31.72 
 
 
462 aa  43.9  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>