31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3200 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3200  putative phage tail protein  100 
 
 
478 aa  929    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1813  hypothetical protein  32.97 
 
 
458 aa  177  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0977  hypothetical protein  31.03 
 
 
452 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1885  hypothetical protein  33.89 
 
 
458 aa  173  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3701  hypothetical protein  31.78 
 
 
428 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4147  hypothetical protein  30.06 
 
 
461 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4022  hypothetical protein  31.71 
 
 
416 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483809  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0063  hypothetical protein  29.89 
 
 
478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2968  hypothetical protein  35.08 
 
 
462 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0473  hypothetical protein  31.86 
 
 
496 aa  76.6  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.926396 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1351  hypothetical protein  40.54 
 
 
431 aa  75.5  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.144812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0287  hypothetical protein  28.15 
 
 
432 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3417  hypothetical protein  27.75 
 
 
475 aa  70.5  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0734  hypothetical protein  30.41 
 
 
768 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0120  hypothetical protein  35.25 
 
 
313 aa  64.3  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.954008  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0564  hypothetical protein  29.76 
 
 
446 aa  63.9  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4469  hypothetical protein  29.55 
 
 
669 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0748  hypothetical protein  29.41 
 
 
762 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0258  hypothetical protein  34.84 
 
 
469 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140181  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.73 
 
 
734 aa  52.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4535  hypothetical protein  30.13 
 
 
699 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0159  hypothetical protein  32.09 
 
 
433 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.53716  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6207  hypothetical protein  32.09 
 
 
433 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143416  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0707  hypothetical protein  27.99 
 
 
776 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579988  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0048  hypothetical protein  27.78 
 
 
463 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03843  conserved hypothetical protein  25.33 
 
 
618 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0313  hypothetical protein  29.25 
 
 
476 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1559  hypothetical protein  26.47 
 
 
425 aa  48.5  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2912  hypothetical protein  31.34 
 
 
429 aa  47.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0303561  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2827  hypothetical protein  26.65 
 
 
439 aa  47.4  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05310  mitochondrion protein, putative  33.33 
 
 
725 aa  43.9  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>