18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0564 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0564  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  857    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0473  hypothetical protein  55.23 
 
 		 496 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.926396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0287  hypothetical protein  47.01 
 
 		 432 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0048  hypothetical protein  45.25 
 
 		 463 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0258  hypothetical protein  39.89 
 
 		 469 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140181  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0468  hypothetical protein  40.64 
 
 		 479 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.252316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0313  hypothetical protein  41.84 
 
 		 476 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4147  hypothetical protein  27.32 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4022  hypothetical protein  26.93 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483809  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3200  putative phage tail protein  29.5 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1559  hypothetical protein  31.37 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3701  hypothetical protein  27.07 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0734  hypothetical protein  34.31 
 
 		 768 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0748  hypothetical protein  34.31 
 
 		 762 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0707  hypothetical protein  30.56 
 
 		 776 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4535  hypothetical protein  30.52 
 
 		 699 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2968  hypothetical protein  23.97 
 
 		 462 aa  47.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1189  hypothetical protein  29.82 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.826438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>