13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0468 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0468  hypothetical protein  100 
 
 		 479 aa  909    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.252316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0313  hypothetical protein  62.5 
 
 		 476 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0258  hypothetical protein  56.27 
 
 		 469 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140181  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0048  hypothetical protein  47.2 
 
 		 463 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0287  hypothetical protein  40.62 
 
 		 432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0564  hypothetical protein  40.87 
 
 		 446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0473  hypothetical protein  39.53 
 
 		 496 aa  173  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.926396 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1189  hypothetical protein  26.44 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.826438 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4147  hypothetical protein  27.42 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3200  putative phage tail protein  26.74 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1351  hypothetical protein  34.09 
 
 		 431 aa  53.5  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4535  hypothetical protein  29.29 
 
 		 699 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1559  hypothetical protein  29.05 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>