14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0313 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0313  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  878    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0468  hypothetical protein  64.78 
 
 		 479 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.252316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0258  hypothetical protein  51.66 
 
 		 469 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140181  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0048  hypothetical protein  42.94 
 
 		 463 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0564  hypothetical protein  42.81 
 
 		 446 aa  179  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0473  hypothetical protein  40.17 
 
 		 496 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.926396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0287  hypothetical protein  40.12 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3200  putative phage tail protein  27.25 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1559  hypothetical protein  33.63 
 
 		 425 aa  53.5  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1189  hypothetical protein  25.8 
 
 		 444 aa  49.3  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.826438 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4147  hypothetical protein  28.26 
 
 		 461 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1351  hypothetical protein  34.09 
 
 		 431 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0707  hypothetical protein  29.11 
 
 		 776 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0734  hypothetical protein  30.86 
 
 		 768 aa  43.5  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>