23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2913 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2913  uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 247 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.155433 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6208  hypothetical protein  82.59 
 
 		 247 aa  298  5e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0160  uroporphyrinogen III synthase HEM4  82.19 
 
 		 247 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.609273  normal  0.657223 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3416  uroporphyrinogen-III synthase  39.66 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4081  uroporphyrinogen-III synthase, putative  35.74 
 
 		 231 aa  102  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2828  uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.68 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1997  putative uroporphyrinogen-III synthase  39.46 
 
 		 224 aa  90.9  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0119  uroporphyrinogen III synthase HEM4  40.95 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1000  uroporphyrinogen-III synthase, putative  24.9 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0374763  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.2 
 
 		 734 aa  72.8  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0047  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.33 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1350  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.03 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0706582 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0257  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.24 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013852  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1159  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.33 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0469  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.92 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0288  putative uroporphyrinogen-III synthase  30 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4534  uroporphyrinogen III synthase HEM4  40.25 
 
 		 262 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0733  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.76 
 
 		 236 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0314  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.96 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4324  hypothetical protein  30.17 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328763 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1890  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  41.01 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0892  Uroporphyrinogen-III synthase  29.69 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1514  uroporphyrinogen-III synthase  28.31 
 
 		 247 aa  42.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>