64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1890 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1890  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 238 aa  453  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10455  uroporphyrinogen-III synthase (UroS), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12800)  31.06 
 
 		 310 aa  105  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.717661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59732  Uroporphyrinogen-III synthase (UROS) (Uroporphyrinogen-III cosynthetase) (Hydroxymethylbilane hydrolyase [cyclizing]) (UROIIIS)  29.76 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.851052  hitchhiker  0.00718151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6501  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.14 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.429257 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0873  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.52 
 
 		 255 aa  71.6  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03635  Uroporphyrinogen-III synthase  30.73 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.32733  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3227  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.53 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0100705  normal  0.638132 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0945  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.99 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349608  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1228  uroporphyrinogen-III synthase  26.13 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0169  uroporphyrinogen-III synthase  24.45 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2913  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.91 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.195548  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02510  uroporphyrinogen-III synthase, putative  27.47 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2985  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.67 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.202243  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1751  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.77 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.17 
 
 		 734 aa  58.9  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3700  uroporphyrinogen-III synthase  33.53 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3201  uroporphyrinogen-III synthase  31.71 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4146  uroporphyrinogen-III synthase  32.47 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373106  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3179  uroporphyrinogen-III synthase  28.86 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0251  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.94 
 
 		 490 aa  52.4  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1399  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.35 
 
 		 226 aa  52.4  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.110691 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2070  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.48 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239723  normal  0.0510209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0486  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.04 
 
 		 263 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.473173 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2491  uroporphyrinogen-III synthase  33.19 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1477  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.48 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  28.05 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  28.05 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4021  uroporphyrinogen-III synthase  31.91 
 
 		 235 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1514  uroporphyrinogen-III synthase  30.41 
 
 		 247 aa  48.5  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1461  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.16 
 
 		 264 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0119  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.41 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0006  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.54 
 
 		 253 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  28.81 
 
 		 513 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1364  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.16 
 
 		 264 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.222114  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0469  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.89 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0047  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.78 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4081  uroporphyrinogen-III synthase, putative  30.5 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4308  uroporphyrinogen-III synthase  22.92 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0653  uroporphyrinogen-III synthase  24.6 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0008  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.76 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000296597  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  27.62 
 
 		 515 aa  46.6  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0127  uroporphyrinogen III synthase HEM4  40 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1000  uroporphyrinogen-III synthase, putative  21.76 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0374763  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0423  uroporphyrinogen-III synthase  26.25 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3476  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.52 
 
 		 270 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2579  Uroporphyrinogen-III synthase  26.17 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1381  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.71 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4196  uroporphyrinogen-III synthase  23.37 
 
 		 250 aa  45.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  29.96 
 
 		 276 aa  45.8  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000190734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4581  uroporphyrinogen-III synthase  24.31 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2031  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.95 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.776715 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4324  hypothetical protein  27.31 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0733  uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.24 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4554  uroporphyrinogen-III synthase  24.12 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4207  uroporphyrinogen-III synthase  23.37 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0596  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0747  uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.24 
 
 		 236 aa  43.9  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01650  possible uroporphyrinogen-III synthase  22.71 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4599  uroporphyrinogen-III synthase  24.89 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0708  uroporphyrin-III C-methyltransferase  19.23 
 
 		 464 aa  42.7  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0160  uroporphyrinogen III synthase HEM4  39.87 
 
 		 247 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.609273  normal  0.657223 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1244  uroporphyrinogen-III synthase  21.12 
 
 		 244 aa  42  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6208  hypothetical protein  39.87 
 
 		 247 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0896  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.53 
 
 		 506 aa  41.6  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>