67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2913 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2913  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 260 aa  537  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.195548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3227  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  74.6 
 
 		 261 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0100705  normal  0.638132 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0169  uroporphyrinogen-III synthase  71.71 
 
 		 265 aa  385  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0382  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  63.45 
 
 		 256 aa  329  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01650  possible uroporphyrinogen-III synthase  59.59 
 
 		 248 aa  301  8.000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0556  uroporphyrinogen III synthase HEM4  57.96 
 
 		 249 aa  293  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0486  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  54.62 
 
 		 263 aa  286  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.473173 
 
 
-
 
NC_002950  PG0202  uroporphyrinogen-III synthase HemD, putative  53.72 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0607  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  50 
 
 		 249 aa  256  3e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.654213  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1890  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.91 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6501  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.47 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.429257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1751  uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.59 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5697  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.1 
 
 		 527 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4438  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  26.73 
 
 		 526 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2031  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.36 
 
 		 269 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.776715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0358  uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.59 
 
 		 526 aa  53.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0428  uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.08 
 
 		 526 aa  52  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256746  hitchhiker  0.000733658 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1341  Uroporphyrinogen-III synthase  24.48 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0949  Uroporphyrinogen-III synthase  23.77 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2731  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  26.52 
 
 		 563 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.510631  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1514  uroporphyrinogen-III synthase  25 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.38 
 
 		 508 aa  49.7  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  25.83 
 
 		 516 aa  49.7  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0236  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  25 
 
 		 528 aa  49.3  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0487  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  25.52 
 
 		 607 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.188044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4599  uroporphyrinogen-III synthase  25.26 
 
 		 250 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6129  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.48 
 
 		 604 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143048  normal  0.442264 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3374  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.15 
 
 		 509 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3325  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  22.83 
 
 		 512 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3179  uroporphyrinogen-III synthase  23.44 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0358  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.69 
 
 		 510 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0669  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  23.46 
 
 		 567 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0653  uroporphyrinogen-III synthase  25 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1540  Uroporphyrinogen-III synthase  23.74 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221664  hitchhiker  0.00271946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8324  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.13 
 
 		 594 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0619  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  23.17 
 
 		 607 aa  46.6  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0627947 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4554  uroporphyrinogen-III synthase  25.26 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0691  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  22.91 
 
 		 554 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.212228 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0671  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  22.91 
 
 		 554 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0678  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  22.91 
 
 		 554 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59732  Uroporphyrinogen-III synthase (UROS) (Uroporphyrinogen-III cosynthetase) (Hydroxymethylbilane hydrolyase [cyclizing]) (UROIIIS)  27.56 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.851052  hitchhiker  0.00718151 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4207  uroporphyrinogen-III synthase  26.29 
 
 		 250 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02870  uroporphyrinogen-III synthase /uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  22.22 
 
 		 516 aa  45.8  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.052713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  23.41 
 
 		 513 aa  45.8  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6728  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  22.4 
 
 		 510 aa  45.8  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1687  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  24.28 
 
 		 492 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0805383  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1421  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  24.28 
 
 		 492 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16426  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0846  uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.35 
 
 		 571 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.75971  normal  0.92956 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4578  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  20.99 
 
 		 516 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4196  uroporphyrinogen-III synthase  25.26 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1015  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  22.4 
 
 		 577 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10522  uroporphyrin-III C-methyltransferase hemD  21.79 
 
 		 565 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2092  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.04 
 
 		 281 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4581  uroporphyrinogen-III synthase  24.48 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0932  Uroporphyrinogen-III synthase  24.27 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0516  uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.66 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.655378  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0065  uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.35 
 
 		 569 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255039  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.34 
 
 		 505 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  22.61 
 
 		 515 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0263  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  24.5 
 
 		 526 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.240357  normal  0.829698 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  21.82 
 
 		 511 aa  43.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1392  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.73 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1244  uroporphyrinogen-III synthase  22.03 
 
 		 244 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0873  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.77 
 
 		 255 aa  42.4  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1376  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.26 
 
 		 258 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03635  Uroporphyrinogen-III synthase  25.48 
 
 		 217 aa  42.4  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.32733  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3666  Na+/H+ antiporter NhaA  22.58 
 
 		 290 aa  42  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.232778  normal  0.349209 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>