77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3227 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3227  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 261 aa  540  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0100705  normal  0.638132 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2913  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  74.6 
 
 		 260 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.195548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0169  uroporphyrinogen-III synthase  67.84 
 
 		 265 aa  374  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0382  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  58.1 
 
 		 256 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0486  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  52.82 
 
 		 263 aa  276  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.473173 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01650  possible uroporphyrinogen-III synthase  53.47 
 
 		 248 aa  268  5.9999999999999995e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0556  uroporphyrinogen III synthase HEM4  52.03 
 
 		 249 aa  261  4.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0202  uroporphyrinogen-III synthase HemD, putative  48.15 
 
 		 248 aa  253  3e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0607  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  46.34 
 
 		 249 aa  239  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.654213  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1890  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.02 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1751  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.13 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4599  uroporphyrinogen-III synthase  26.29 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4207  uroporphyrinogen-III synthase  27.23 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4554  uroporphyrinogen-III synthase  26.67 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0653  uroporphyrinogen-III synthase  27.32 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3374  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.32 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4581  uroporphyrinogen-III synthase  26.8 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4196  uroporphyrinogen-III synthase  26.29 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1514  uroporphyrinogen-III synthase  25.2 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.9 
 
 		 505 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6501  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.45 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.429257 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4308  uroporphyrinogen-III synthase  26.29 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4360  uroporphyrinogen-III synthase  26.8 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.578422  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5697  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.37 
 
 		 527 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4695  uroporphyrinogen-III synthase  26.8 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0358  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.6 
 
 		 510 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4550  uroporphyrinogen-III synthase  26.8 
 
 		 250 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.56 
 
 		 508 aa  52.4  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1341  Uroporphyrinogen-III synthase  24.87 
 
 		 266 aa  52  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1797  uroporphyrinogen-III synthase  25.87 
 
 		 251 aa  52  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0201801  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  25.67 
 
 		 513 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0358  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.1 
 
 		 526 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0932  Uroporphyrinogen-III synthase  23.94 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1421  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  25.3 
 
 		 492 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16426  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59732  Uroporphyrinogen-III synthase (UROS) (Uroporphyrinogen-III cosynthetase) (Hydroxymethylbilane hydrolyase [cyclizing]) (UROIIIS)  29.32 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.851052  hitchhiker  0.00718151 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1540  Uroporphyrinogen-III synthase  26.48 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221664  hitchhiker  0.00271946 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.53 
 
 		 512 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1376  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.68 
 
 		 258 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1687  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  25.3 
 
 		 492 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0805383  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0428  uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.59 
 
 		 526 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256746  hitchhiker  0.000733658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2031  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.5 
 
 		 269 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.776715 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  27.13 
 
 		 276 aa  49.3  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000190734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0873  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.26 
 
 		 255 aa  48.9  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3476  uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.41 
 
 		 270 aa  48.5  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1837  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.36 
 
 		 247 aa  48.9  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3179  uroporphyrinogen-III synthase  25 
 
 		 252 aa  48.9  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1023  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.89 
 
 		 493 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0949  Uroporphyrinogen-III synthase  24.8 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0251  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.12 
 
 		 490 aa  47.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0945  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.88 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349608  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3549  uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.19 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  25.21 
 
 		 505 aa  46.6  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0596  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.29 
 
 		 214 aa  46.2  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2528  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  25.28 
 
 		 493 aa  46.2  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  25.97 
 
 		 515 aa  46.2  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25 
 
 		 507 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1555  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.98 
 
 		 545 aa  45.4  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6728  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  23.83 
 
 		 510 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1428  uroporphyrinogen-III synthase  23.26 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4438  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  25 
 
 		 526 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1015  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  23.44 
 
 		 577 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.6 
 
 		 511 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02870  uroporphyrinogen-III synthase /uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  22.73 
 
 		 516 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.052713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.73 
 
 		 511 aa  43.9  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  24.71 
 
 		 513 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  20.92 
 
 		 513 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0236  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  24.87 
 
 		 528 aa  43.9  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5880  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.82 
 
 		 492 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0669  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  22.91 
 
 		 567 aa  43.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  24.18 
 
 		 516 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26800  uroporphyrinogen-III synthase  22.22 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.18 
 
 		 510 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0708  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.79 
 
 		 464 aa  43.5  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10522  uroporphyrin-III C-methyltransferase hemD  23.46 
 
 		 565 aa  43.5  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2491  uroporphyrinogen-III synthase  25.56 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1262  uroporphyrinogen-III synthase  25.43 
 
 		 211 aa  42.7  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03635  Uroporphyrinogen-III synthase  26.58 
 
 		 217 aa  42  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.32733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>