33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1837 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1837  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 
247 aa  481  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1514  uroporphyrinogen-III synthase  28.07 
 
 
247 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.1 
 
 
503 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.4 
 
 
503 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2449  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.03 
 
 
502 aa  52.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.448467  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0949  Uroporphyrinogen-III synthase  27.56 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0945  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.74 
 
 
221 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349608  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3374  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.1 
 
 
509 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1399  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.06 
 
 
226 aa  50.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.110691 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0873  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.16 
 
 
255 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3201  uroporphyrinogen-III synthase  32.12 
 
 
232 aa  49.3  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3179  uroporphyrinogen-III synthase  31.05 
 
 
252 aa  48.9  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3227  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.36 
 
 
261 aa  48.9  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0100705  normal  0.638132 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  25.99 
 
 
516 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.89 
 
 
503 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.11 
 
 
507 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4550  uroporphyrinogen-III synthase  25.39 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4360  uroporphyrinogen-III synthase  25.65 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.578422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4695  uroporphyrinogen-III synthase  25.65 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1540  Uroporphyrinogen-III synthase  25.78 
 
 
249 aa  46.2  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221664  hitchhiker  0.00271946 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4581  uroporphyrinogen-III synthase  25.52 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1428  uroporphyrinogen-III synthase  24.67 
 
 
248 aa  46.2  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0653  uroporphyrinogen-III synthase  26.56 
 
 
250 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4207  uroporphyrinogen-III synthase  25.13 
 
 
250 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03635  Uroporphyrinogen-III synthase  27.61 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.32733  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0169  uroporphyrinogen-III synthase  24.51 
 
 
265 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  27.69 
 
 
520 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4308  uroporphyrinogen-III synthase  25.53 
 
 
250 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4196  uroporphyrinogen-III synthase  24.06 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  28.63 
 
 
513 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4554  uroporphyrinogen-III synthase  24.6 
 
 
250 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1421  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  23.35 
 
 
492 aa  42.4  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4599  uroporphyrinogen-III synthase  24.6 
 
 
250 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>