73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3201 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3201  uroporphyrinogen-III synthase  100 
 
 		 232 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  40.83 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  40.83 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0976  uroporphyrinogen-III synthase  39.08 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4146  uroporphyrinogen-III synthase  33.76 
 
 		 238 aa  95.5  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373106  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4534  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.45 
 
 		 262 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3700  uroporphyrinogen-III synthase  35.29 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0288  putative uroporphyrinogen-III synthase  32.5 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2070  uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.5 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239723  normal  0.0510209 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0257  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.38 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013852  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0314  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.96 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1159  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.62 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2967  uroporphyrinogen-III synthase  33.47 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.03 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0047  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.25 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0472  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.99 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0119  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.44 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0469  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.71 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.03 
 
 		 734 aa  70.1  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2877  uroporphyrinogen-III synthase  41.06 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0747  uroporphyrinogen III synthase HEM4  39.04 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0733  uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.36 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0006  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.35 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4021  uroporphyrinogen-III synthase  32.37 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1937  uroporphyrinogen III synthase HEM4  42 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0356015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0127  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.59 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2828  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.49 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4081  uroporphyrinogen-III synthase, putative  30.3 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.94 
 
 		 508 aa  58.5  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1350  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.65 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0706582 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0008  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.99 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000296597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  26.52 
 
 		 516 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0873  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.22 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0706  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.78 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827185 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1540  Uroporphyrinogen-III synthase  28.9 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221664  hitchhiker  0.00271946 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0736  uroporphyrinogen-III synthase  29.51 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512163 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1890  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.71 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0041  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.62 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0197  uroporphyrinogen-III synthase  27.42 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00133341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0535  uroporphyrinogen-III synthase  27.42 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4017  uroporphyrinogen-III synthase  27.42 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.405149  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3476  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.36 
 
 		 270 aa  53.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.32 
 
 		 505 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0034  uroporphyrinogen-III synthase  25.79 
 
 		 256 aa  52.8  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5486  uroporphyrinogen-III synthase  29.53 
 
 		 255 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0546  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24 
 
 		 240 aa  52  0.000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4468  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.9 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0932  Uroporphyrinogen-III synthase  29.48 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1837  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.12 
 
 		 247 aa  49.3  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.66 
 
 		 504 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0480  uroporphyrinogen-III synthase  22.27 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4172  uroporphyrinogen-III synthase  24.8 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0344779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2579  Uroporphyrinogen-III synthase  25.79 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0043  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.63 
 
 		 494 aa  46.6  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.655247  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0290  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.96 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.583848  normal  0.971702 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0185  uroporphyrinogen-III synthase  26.6 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  30.06 
 
 		 503 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3981  uroporphyrinogen-III synthase  25.91 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000864571  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1797  uroporphyrinogen-III synthase  27.22 
 
 		 251 aa  45.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0201801  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0945  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.57 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349608  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2787  uroporphyrinogen-III synthase  35.36 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1997  putative uroporphyrinogen-III synthase  32.02 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0387  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.27 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1514  uroporphyrinogen-III synthase  26.52 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4314  uroporphyrinogen-III synthase  27.03 
 
 		 246 aa  42.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1278  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.68 
 
 		 504 aa  42.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0892  Uroporphyrinogen-III synthase  25.58 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0486  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28 
 
 		 270 aa  42  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0949  Uroporphyrinogen-III synthase  28.37 
 
 		 247 aa  42  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0765  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.79 
 
 		 267 aa  42  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000129403 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1716  uroporphyrinogen III synthase  28.17 
 
 		 273 aa  41.6  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3639  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.19 
 
 		 232 aa  41.6  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1428  uroporphyrinogen-III synthase  27.61 
 
 		 248 aa  41.6  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>