41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2070 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2070  uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 239 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239723  normal  0.0510209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4534  uroporphyrinogen III synthase HEM4  57.56 
 
 		 262 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0733  uroporphyrinogen III synthase HEM4  55.42 
 
 		 236 aa  185  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0747  uroporphyrinogen III synthase HEM4  55.83 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0706  uroporphyrinogen III synthase HEM4  55.65 
 
 		 242 aa  178  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4468  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  57.71 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0008  uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.4 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000296597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1159  uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.96 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0288  putative uroporphyrinogen-III synthase  38.52 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0047  uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.52 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0257  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.14 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013852  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0314  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.2 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1350  uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.3 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0706582 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.9 
 
 		 248 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0469  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.77 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0472  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.84 
 
 		 248 aa  89  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3201  uroporphyrinogen-III synthase  38.5 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0006  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.24 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0290  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.39 
 
 		 245 aa  85.9  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.583848  normal  0.971702 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  33.19 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  33.19 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0976  uroporphyrinogen-III synthase  39.74 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0119  uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.33 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.48 
 
 		 734 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0127  uroporphyrinogen III synthase HEM4  42.28 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4146  uroporphyrinogen-III synthase  31.82 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373106  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0041  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.4 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0736  uroporphyrinogen-III synthase  30.86 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512163 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2967  uroporphyrinogen-III synthase  35.08 
 
 		 238 aa  62  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4324  hypothetical protein  31.4 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328763 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3700  uroporphyrinogen-III synthase  33.88 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1000  uroporphyrinogen-III synthase, putative  19.49 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0374763  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1890  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.48 
 
 		 238 aa  53.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1937  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.55 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0356015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4021  uroporphyrinogen-III synthase  31.67 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0236  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  28.68 
 
 		 528 aa  50.1  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1997  putative uroporphyrinogen-III synthase  43.75 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4081  uroporphyrinogen-III synthase, putative  31.72 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0619  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  28.68 
 
 		 607 aa  45.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0627947 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0493  uroporphyrinogen-III synthase  28.7 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.5 
 
 		 504 aa  42.7  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>