21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0493 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0493  uroporphyrinogen-III synthase  100 
 
 
212 aa  428  1e-119  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0948  uroporphyrinogen-III synthase  57.94 
 
 
214 aa  247  1e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1262  uroporphyrinogen-III synthase  51.2 
 
 
211 aa  209  2e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0596  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  39.71 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1483  uroporphyrinogen-III synthase  42.31 
 
 
211 aa  151  7e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.217942  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1228  uroporphyrinogen-III synthase  38.46 
 
 
302 aa  137  7.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1121  uroporphyrinogen-III synthase  35.38 
 
 
212 aa  124  1e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.629537  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1223  uroporphyrinogen-III synthase  37.74 
 
 
209 aa  121  7e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.732844  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1098  uroporphyrinogen-III synthase  38.21 
 
 
209 aa  121  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.236356  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0644  uroporphyrinogen-III synthase  37.26 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.222948  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0423  uroporphyrinogen-III synthase  31.9 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1000  uroporphyrinogen-III synthase, putative  27.63 
 
 
235 aa  53.9  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0374763  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.95 
 
 
248 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0047  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.43 
 
 
248 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  27.86 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  27.86 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0314  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.62 
 
 
265 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0976  uroporphyrinogen-III synthase  26.98 
 
 
244 aa  42.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  25.37 
 
 
276 aa  42.4  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000190734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0469  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.68 
 
 
247 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0472  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.46 
 
 
248 aa  41.6  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.850849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>