43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4021 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4021  uroporphyrinogen-III synthase  100 
 
 		 235 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3700  uroporphyrinogen-III synthase  81.28 
 
 		 235 aa  367  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4146  uroporphyrinogen-III synthase  42.44 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373106  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2967  uroporphyrinogen-III synthase  42.19 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  33.33 
 
 		 235 aa  99  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  33.33 
 
 		 235 aa  99  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0047  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.68 
 
 		 248 aa  98.2  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0257  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.11 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013852  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0314  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.73 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0976  uroporphyrinogen-III synthase  32.22 
 
 		 244 aa  89  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0469  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.81 
 
 		 247 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0288  putative uroporphyrinogen-III synthase  33.46 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0472  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.6 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3201  uroporphyrinogen-III synthase  32.24 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1159  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.61 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.2 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0290  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.38 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.583848  normal  0.971702 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0006  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.5 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0736  uroporphyrinogen-III synthase  32.79 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512163 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.58 
 
 		 734 aa  64.3  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0119  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.71 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0008  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.92 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000296597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4534  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.67 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0480  uroporphyrinogen-III synthase  22.31 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0747  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.75 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1937  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.51 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0356015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4324  hypothetical protein  27.71 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0733  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.04 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2070  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.13 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239723  normal  0.0510209 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0546  uroporphyrinogen III synthase HEM4  21.99 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2828  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.56 
 
 		 245 aa  52.8  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0041  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.38 
 
 		 245 aa  52.4  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1890  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.73 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1350  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.08 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0706582 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0127  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.98 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  22.66 
 
 		 516 aa  46.2  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1540  Uroporphyrinogen-III synthase  25.79 
 
 		 249 aa  45.4  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221664  hitchhiker  0.00271946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4468  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.09 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0706  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.45 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827185 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3416  uroporphyrinogen-III synthase  26.91 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0441  hypothetical protein  27.42 
 
 		 236 aa  42  0.007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.964124  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1098  uroporphyrinogen-III synthase  24 
 
 		 209 aa  42  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.236356  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3981  uroporphyrinogen-III synthase  24.02 
 
 		 246 aa  42  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000864571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>