61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0257 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0257  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 248 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013852  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0314  uroporphyrinogen III synthase HEM4  82.19 
 
 		 265 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0469  uroporphyrinogen III synthase HEM4  81.78 
 
 		 247 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0047  uroporphyrinogen III synthase HEM4  67.35 
 
 		 248 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  60.82 
 
 		 248 aa  280  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0288  putative uroporphyrinogen-III synthase  60.91 
 
 		 245 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0472  uroporphyrinogen III synthase HEM4  59.11 
 
 		 248 aa  250  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1159  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.56 
 
 		 232 aa  115  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1350  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.29 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0706582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4534  uroporphyrinogen III synthase HEM4  40.25 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0733  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.85 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.02 
 
 		 734 aa  102  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0706  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.36 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827185 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0290  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.58 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.583848  normal  0.971702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0747  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.27 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  31.95 
 
 		 235 aa  95.9  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  31.95 
 
 		 235 aa  95.9  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3700  uroporphyrinogen-III synthase  34.94 
 
 		 235 aa  95.5  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4324  hypothetical protein  29.83 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2070  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.11 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239723  normal  0.0510209 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0976  uroporphyrinogen-III synthase  31.38 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4021  uroporphyrinogen-III synthase  35.89 
 
 		 235 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1000  uroporphyrinogen-III synthase, putative  24.69 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0374763  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4468  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.68 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2967  uroporphyrinogen-III synthase  32.39 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0041  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.47 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0008  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.71 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000296597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3201  uroporphyrinogen-III synthase  31.38 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0006  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.29 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0127  uroporphyrinogen III synthase HEM4  40.7 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4146  uroporphyrinogen-III synthase  31.3 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373106  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0480  uroporphyrinogen-III synthase  21.85 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0441  hypothetical protein  29.67 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.964124  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0546  uroporphyrinogen III synthase HEM4  21.05 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0736  uroporphyrinogen-III synthase  27.89 
 
 		 259 aa  67  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512163 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1937  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.71 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0356015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1751  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.2 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  26.8 
 
 		 520 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0119  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.63 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0212  uroporphyrinogen-III synthase  29.02 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2031  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.18 
 
 		 269 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.776715 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2787  uroporphyrinogen-III synthase  28.3 
 
 		 226 aa  48.9  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5486  uroporphyrinogen-III synthase  30.8 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1477  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.88 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1540  Uroporphyrinogen-III synthase  23.53 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221664  hitchhiker  0.00271946 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0949  Uroporphyrinogen-III synthase  29.63 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0185  uroporphyrinogen-III synthase  31.25 
 
 		 237 aa  45.8  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0209  uroporphyrinogen-III synthase  28.91 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0263  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  27.45 
 
 		 526 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.240357  normal  0.829698 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0043  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.8 
 
 		 494 aa  44.3  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.655247  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0008  uroporphyrinogen-III synthase  23.19 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0960218  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4438  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  26.85 
 
 		 526 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0187  uroporphyrinogen-III synthase  28.52 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2877  uroporphyrinogen-III synthase  32.28 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1098  uroporphyrinogen-III synthase  30 
 
 		 209 aa  43.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.236356  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2173  uroporphyrinogen-III synthase  23.19 
 
 		 268 aa  42.7  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1428  uroporphyrinogen-III synthase  31.46 
 
 		 248 aa  42.7  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1223  uroporphyrinogen-III synthase  29.36 
 
 		 209 aa  42  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.732844  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1514  uroporphyrinogen-III synthase  26.11 
 
 		 247 aa  42  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0178  uroporphyrinogen-III synthase  24.51 
 
 		 246 aa  42  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0118658  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2689  uroporphyrinogen-III synthase  26.48 
 
 		 260 aa  42  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>