48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01650 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01650  possible uroporphyrinogen-III synthase  100 
 
 		 248 aa  507  1e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0556  uroporphyrinogen III synthase HEM4  73.68 
 
 		 249 aa  395  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0607  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  60.08 
 
 		 249 aa  333  1e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.654213  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2913  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  59.59 
 
 		 260 aa  301  8.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.195548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0382  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  57.72 
 
 		 256 aa  298  7e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0169  uroporphyrinogen-III synthase  57.14 
 
 		 265 aa  285  5.999999999999999e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3227  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  53.47 
 
 		 261 aa  268  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0100705  normal  0.638132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0486  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  51.81 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.473173 
 
 
-
 
NC_002950  PG0202  uroporphyrinogen-III synthase HemD, putative  45.68 
 
 		 248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0653  uroporphyrinogen-III synthase  27.56 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4581  uroporphyrinogen-III synthase  27.11 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4599  uroporphyrinogen-III synthase  27.11 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1341  Uroporphyrinogen-III synthase  25 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4554  uroporphyrinogen-III synthase  27.11 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4308  uroporphyrinogen-III synthase  25.78 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0358  uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.92 
 
 		 526 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4360  uroporphyrinogen-III synthase  25.78 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.578422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4196  uroporphyrinogen-III synthase  26.11 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4695  uroporphyrinogen-III synthase  25.78 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1751  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.15 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4550  uroporphyrinogen-III synthase  25.78 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4207  uroporphyrinogen-III synthase  26.67 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5697  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.9 
 
 		 527 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0236  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  29.06 
 
 		 528 aa  50.4  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4370  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  28.1 
 
 		 562 aa  49.7  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.12 
 
 		 512 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  25.12 
 
 		 516 aa  49.7  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3374  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.09 
 
 		 509 aa  49.7  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.53 
 
 		 508 aa  48.9  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3549  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.32 
 
 		 266 aa  48.5  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2092  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.87 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0619  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  28.21 
 
 		 607 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0627947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8324  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.81 
 
 		 594 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2579  Uroporphyrinogen-III synthase  25.49 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0263  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  25.25 
 
 		 526 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.240357  normal  0.829698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4438  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  28.21 
 
 		 526 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0496  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  29.06 
 
 		 552 aa  46.2  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2731  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  30.77 
 
 		 563 aa  45.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.510631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0873  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.74 
 
 		 255 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.5 
 
 		 511 aa  45.4  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2031  uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.97 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.776715 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.92 
 
 		 507 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0596  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.15 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3179  uroporphyrinogen-III synthase  23.23 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0550  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen- III C-methyltransferase  29.52 
 
 		 526 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.746354  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1890  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.71 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2562  uroporphyrinogen-III synthase  24.12 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  24.1 
 
 		 513 aa  42  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>