17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6501 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6501  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 248 aa  513  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.429257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0945  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.65 
 
 		 221 aa  98.6  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349608  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03635  Uroporphyrinogen-III synthase  33.53 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.32733  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1890  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.14 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1477  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.5 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2913  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.04 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.195548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0169  uroporphyrinogen-III synthase  25.89 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3227  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.45 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0100705  normal  0.638132 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0873  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.23 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.82 
 
 		 507 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1399  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.09 
 
 		 226 aa  45.8  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.110691 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10455  uroporphyrinogen-III synthase (UroS), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12800)  28.46 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.717661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0486  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.4 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.473173 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1540  Uroporphyrinogen-III synthase  28.73 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221664  hitchhiker  0.00271946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  25.13 
 
 		 516 aa  43.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02510  uroporphyrinogen-III synthase, putative  29.91 
 
 		 299 aa  42.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4207  uroporphyrinogen-III synthase  27.55 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>