120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0516 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0516  uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 
244 aa  483  1e-135  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.655378  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1392  uroporphyrinogen III synthase HEM4  89.34 
 
 
244 aa  441  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1244  uroporphyrinogen-III synthase  90.16 
 
 
244 aa  437  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1381  uroporphyrinogen III synthase HEM4  65.16 
 
 
246 aa  324  1e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0075  uroporphyrinogen III synthase HEM4  56.15 
 
 
246 aa  262  4e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.29766  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  30.35 
 
 
505 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  29.46 
 
 
516 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  29.92 
 
 
513 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1341  Uroporphyrinogen-III synthase  32.93 
 
 
266 aa  102  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11620  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.55 
 
 
546 aa  102  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.5 
 
 
504 aa  99.4  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.12 
 
 
512 aa  99  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.02 
 
 
503 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.69 
 
 
510 aa  97.1  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.18 
 
 
519 aa  96.7  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.8 
 
 
512 aa  96.7  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.69 
 
 
511 aa  97.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.21 
 
 
503 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  28.51 
 
 
503 aa  95.9  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.95 
 
 
511 aa  95.5  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12360  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.87 
 
 
579 aa  93.2  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.17 
 
 
508 aa  93.6  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0358  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28 
 
 
510 aa  93.6  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.91 
 
 
507 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.17 
 
 
497 aa  92.8  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3374  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.56 
 
 
509 aa  92.4  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.34 
 
 
513 aa  92  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0896  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.41 
 
 
506 aa  90.1  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.38 
 
 
505 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  24.62 
 
 
276 aa  87.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000190734  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2449  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.95 
 
 
502 aa  86.3  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.448467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  26 
 
 
515 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.71 
 
 
504 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  25.3 
 
 
520 aa  82.4  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2562  uroporphyrinogen-III synthase  27.84 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1346  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.59 
 
 
511 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.694338  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2579  Uroporphyrinogen-III synthase  28.34 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0653  uroporphyrinogen-III synthase  30.12 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3549  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4599  uroporphyrinogen-III synthase  29.72 
 
 
250 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4581  uroporphyrinogen-III synthase  30.12 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5880  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.81 
 
 
492 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204086  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4360  uroporphyrinogen-III synthase  29.32 
 
 
250 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.578422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4695  uroporphyrinogen-III synthase  29.32 
 
 
250 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0185  uroporphyrinogen-III synthase  29.15 
 
 
237 aa  77  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4550  uroporphyrinogen-III synthase  28.92 
 
 
250 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4207  uroporphyrinogen-III synthase  29.2 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4196  uroporphyrinogen-III synthase  28.92 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4554  uroporphyrinogen-III synthase  28.51 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4308  uroporphyrinogen-III synthase  28.51 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2558  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.4 
 
 
506 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1199  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.31 
 
 
491 aa  73.2  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2069  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.67 
 
 
522 aa  72.8  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.198087  hitchhiker  0.000347629 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1028  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.34 
 
 
505 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1057  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.73 
 
 
505 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681167 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1371  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.33 
 
 
502 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1023  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.42 
 
 
493 aa  70.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2897  Uroporphyrinogen-III synthase  22.8 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.116607  normal  0.0810585 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3299  uroporphyrinogen-III synthase  22.8 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.466839  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3179  uroporphyrinogen-III synthase  26.83 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3325  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  27.24 
 
 
512 aa  68.6  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1555  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.24 
 
 
545 aa  67.4  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  25.1 
 
 
513 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1751  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.71 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0251  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.39 
 
 
490 aa  65.1  0.0000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1687  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  28.92 
 
 
492 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0805383  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4844  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.41 
 
 
520 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.839269  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0338  uroporphyrinogen-III synthase  26.69 
 
 
272 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.224423  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1278  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.22 
 
 
504 aa  64.3  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01871  putative uroporphyrinogen III synthase  26.32 
 
 
261 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.773561  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1421  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  27.24 
 
 
492 aa  63.2  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16426  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0932  Uroporphyrinogen-III synthase  26.5 
 
 
249 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3474  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.64 
 
 
517 aa  62.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.027722  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1540  Uroporphyrinogen-III synthase  24.18 
 
 
249 aa  62  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221664  hitchhiker  0.00271946 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0873  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.09 
 
 
255 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2031  uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.37 
 
 
269 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.776715 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.23 
 
 
491 aa  57.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0011  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.57 
 
 
271 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.458741 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1482  putative uroporphyrinogen III synthase  25.19 
 
 
266 aa  55.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.360624  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1106  uroporphyrinogen-III synthase  25 
 
 
266 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000478387  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01311  putative uroporphyrinogen III synthase  26.42 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3476  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.83 
 
 
270 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0949  Uroporphyrinogen-III synthase  27.27 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1428  uroporphyrinogen-III synthase  25.64 
 
 
248 aa  53.5  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2353  uroporphyrinogen-III synthase  24.14 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2528  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  29.66 
 
 
493 aa  53.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01301  putative uroporphyrinogen III synthase  24.33 
 
 
265 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26181  putative uroporphyrinogen III synthase  25.43 
 
 
277 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0043  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.28 
 
 
494 aa  52.4  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.655247  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2092  uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.62 
 
 
281 aa  52  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3075  uroporphyrinogen-III synthase  23.88 
 
 
276 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968047  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1514  uroporphyrinogen-III synthase  25.53 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2669  uroporphyrinogen-III synthase  24.54 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000490526 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1103  uroporphyrinogen-III synthase  26.09 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0908711  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1792  uroporphyrinogen-III synthase  25.58 
 
 
263 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.156972  normal  0.974342 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.79 
 
 
497 aa  50.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000345374  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0736  uroporphyrinogen-III synthase  21.91 
 
 
259 aa  49.7  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.512163 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01291  putative uroporphyrinogen III synthase  27.54 
 
 
282 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.414645 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0116  putative uroporphyrinogen III synthase  24.12 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2178  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.51 
 
 
686 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.280216  hitchhiker  0.000563849 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>