272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3299 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_3299  uroporphyrinogen-III synthase  100 
 
 
262 aa  525  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.466839  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2897  Uroporphyrinogen-III synthase  100 
 
 
262 aa  525  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.116607  normal  0.0810585 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0028  Uroporphyrinogen-III synthase  42.64 
 
 
272 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0011  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  43.36 
 
 
271 aa  185  7e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.458741 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3673  uroporphyrinogen-III synthase  41.67 
 
 
260 aa  162  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2689  uroporphyrinogen-III synthase  40 
 
 
260 aa  159  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0034  uroporphyrinogen-III synthase  37.39 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.59 
 
 
519 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0358  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.4 
 
 
510 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  34.02 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000190734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.94 
 
 
505 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  30.43 
 
 
516 aa  132  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3374  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.06 
 
 
509 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  35.77 
 
 
513 aa  131  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.2 
 
 
511 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.4 
 
 
510 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1438  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.94 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2792  uroporphyrinogen-III synthetase  33.61 
 
 
250 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2661  uroporphyrinogen-III synthetase  33.61 
 
 
250 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3549  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.23 
 
 
266 aa  126  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1341  Uroporphyrinogen-III synthase  34.12 
 
 
266 aa  126  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2567  uroporphyrinogen-III synthase  36.14 
 
 
252 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.16 
 
 
508 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.87 
 
 
512 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0503  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.47 
 
 
265 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.66 
 
 
507 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  34 
 
 
515 aa  122  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3061  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.38 
 
 
672 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  33.33 
 
 
513 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1026  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.84 
 
 
264 aa  119  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.928762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  33.6 
 
 
520 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1751  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.11 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.31 
 
 
512 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24390  uroporphyrinogen-III synthase  35.02 
 
 
558 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0338  uroporphyrinogen-III synthase  35.62 
 
 
272 aa  113  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.224423  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4581  uroporphyrinogen-III synthase  31.35 
 
 
250 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3325  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  31.94 
 
 
512 aa  112  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3474  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  31.27 
 
 
517 aa  112  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.027722  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  30.71 
 
 
505 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1057  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.8 
 
 
505 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681167 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  32.65 
 
 
503 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2669  uroporphyrinogen-III synthase  33.62 
 
 
261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000490526 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0653  uroporphyrinogen-III synthase  31.25 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4844  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.76 
 
 
520 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.839269  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11620  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.27 
 
 
546 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  37.45 
 
 
513 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3179  uroporphyrinogen-III synthase  31.58 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4554  uroporphyrinogen-III synthase  30.71 
 
 
250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1028  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.51 
 
 
505 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2173  uroporphyrinogen-III synthase  34.44 
 
 
268 aa  108  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01291  putative uroporphyrinogen III synthase  34.06 
 
 
282 aa  108  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.414645 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1346  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.5 
 
 
511 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.694338  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0896  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.04 
 
 
506 aa  107  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4360  uroporphyrinogen-III synthase  30.2 
 
 
250 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.578422  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0008  uroporphyrinogen-III synthase  34.02 
 
 
268 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0960218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4695  uroporphyrinogen-III synthase  30.2 
 
 
250 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3988  uroporphyrinogen-III synthase  32.79 
 
 
246 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2353  uroporphyrinogen-III synthase  33.05 
 
 
265 aa  106  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01271  putative uroporphyrinogen III synthase  29.13 
 
 
265 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.190532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4207  uroporphyrinogen-III synthase  30.74 
 
 
250 aa  106  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0272  uroporphyrinogen-III synthase  33.84 
 
 
264 aa  106  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2558  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.15 
 
 
506 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26181  putative uroporphyrinogen III synthase  32.61 
 
 
277 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1482  putative uroporphyrinogen III synthase  31 
 
 
266 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.360624  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4134  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.92 
 
 
244 aa  105  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4196  uroporphyrinogen-III synthase  29.92 
 
 
250 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4308  uroporphyrinogen-III synthase  30.31 
 
 
250 aa  105  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.65 
 
 
504 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4550  uroporphyrinogen-III synthase  29.64 
 
 
250 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.91 
 
 
504 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4599  uroporphyrinogen-III synthase  32 
 
 
250 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.74 
 
 
503 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4172  uroporphyrinogen-III synthase  32.51 
 
 
246 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0344779  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.15 
 
 
503 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2449  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.28 
 
 
502 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.448467  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01871  putative uroporphyrinogen III synthase  30.57 
 
 
261 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.773561  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6129  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.59 
 
 
604 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143048  normal  0.442264 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01301  putative uroporphyrinogen III synthase  27.12 
 
 
265 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.26 
 
 
511 aa  102  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0873  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.25 
 
 
255 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2562  uroporphyrinogen-III synthase  28.35 
 
 
272 aa  102  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4024  uroporphyrinogen-III synthase  31.56 
 
 
246 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00563247  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4203  uroporphyrinogen-III synthase  31.56 
 
 
246 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110892  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5242  uroporphyrinogen-III synthase  31.56 
 
 
246 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03679  uroporphyrinogen-III synthetase  31.56 
 
 
246 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.398858  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4175  Uroporphyrinogen-III synthase  31.56 
 
 
246 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.272222  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03628  hypothetical protein  31.56 
 
 
246 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408532  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2579  Uroporphyrinogen-III synthase  27.6 
 
 
266 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4165  uroporphyrinogen-III synthase  31.28 
 
 
246 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000285608  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4150  uroporphyrinogen-III synthase  31.28 
 
 
246 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01311  putative uroporphyrinogen III synthase  26.27 
 
 
265 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4319  uroporphyrinogen-III synthase  31.56 
 
 
246 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0995416  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4219  uroporphyrinogen-III synthase  31.28 
 
 
246 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.374545  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0358  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.88 
 
 
526 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0428  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.88 
 
 
526 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256746  hitchhiker  0.000733658 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4267  uroporphyrinogen-III synthase  31.28 
 
 
246 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4326  uroporphyrinogen-III synthase  31.28 
 
 
246 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.975314 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4263  uroporphyrinogen-III synthase  31.56 
 
 
246 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2031  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.39 
 
 
269 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.776715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4578  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.04 
 
 
516 aa  99.4  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>