109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1244 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1244  uroporphyrinogen-III synthase  100 
 
 
244 aa  482  1e-135  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1392  uroporphyrinogen III synthase HEM4  90.57 
 
 
244 aa  441  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0516  uroporphyrinogen III synthase HEM4  90.16 
 
 
244 aa  437  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.655378  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1381  uroporphyrinogen III synthase HEM4  65.16 
 
 
246 aa  320  9.999999999999999e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0075  uroporphyrinogen III synthase HEM4  53.69 
 
 
246 aa  250  2e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.29766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.43 
 
 
504 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1341  Uroporphyrinogen-III synthase  32.8 
 
 
266 aa  98.6  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  29.57 
 
 
505 aa  98.2  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.41 
 
 
512 aa  95.9  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  29.72 
 
 
503 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.12 
 
 
512 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.38 
 
 
503 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  29.07 
 
 
516 aa  93.2  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11620  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.04 
 
 
546 aa  93.2  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.61 
 
 
503 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.49 
 
 
511 aa  90.1  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  28.74 
 
 
513 aa  88.6  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.63 
 
 
508 aa  88.6  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2449  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.59 
 
 
502 aa  87.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.448467  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.71 
 
 
504 aa  85.9  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.11 
 
 
519 aa  85.9  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.6 
 
 
510 aa  85.9  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.57 
 
 
507 aa  85.5  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.2 
 
 
511 aa  85.1  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.23 
 
 
513 aa  85.1  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.23 
 
 
505 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0653  uroporphyrinogen-III synthase  30.92 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4581  uroporphyrinogen-III synthase  31.33 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2579  Uroporphyrinogen-III synthase  28.98 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.84 
 
 
497 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1346  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.2 
 
 
511 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.694338  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  26 
 
 
515 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3374  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25 
 
 
509 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0358  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.91 
 
 
510 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4599  uroporphyrinogen-III synthase  29.72 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4196  uroporphyrinogen-III synthase  30.12 
 
 
250 aa  79  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4554  uroporphyrinogen-III synthase  30.12 
 
 
250 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0896  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.48 
 
 
506 aa  78.6  0.00000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4207  uroporphyrinogen-III synthase  30.8 
 
 
250 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2562  uroporphyrinogen-III synthase  27.91 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0185  uroporphyrinogen-III synthase  29.44 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2069  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.02 
 
 
522 aa  78.2  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.198087  hitchhiker  0.000347629 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4360  uroporphyrinogen-III synthase  30.52 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.578422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4695  uroporphyrinogen-III synthase  30.52 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4550  uroporphyrinogen-III synthase  30.12 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1199  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.05 
 
 
491 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12360  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.37 
 
 
579 aa  77.4  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3179  uroporphyrinogen-III synthase  28.46 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2558  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.97 
 
 
506 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4308  uroporphyrinogen-III synthase  29.32 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  23.75 
 
 
276 aa  72  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000190734  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1023  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.98 
 
 
493 aa  71.6  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3549  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.31 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3325  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  27.52 
 
 
512 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  23.69 
 
 
520 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1555  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25 
 
 
545 aa  66.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5880  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.1 
 
 
492 aa  66.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204086  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1028  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.68 
 
 
505 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4844  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.62 
 
 
520 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.839269  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1057  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.07 
 
 
505 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681167 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1371  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.83 
 
 
502 aa  62.8  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3474  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  25.1 
 
 
517 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.027722  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2897  Uroporphyrinogen-III synthase  22.8 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.116607  normal  0.0810585 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3299  uroporphyrinogen-III synthase  22.8 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.466839  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0251  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.75 
 
 
490 aa  61.2  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0873  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.09 
 
 
255 aa  58.5  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  23.62 
 
 
513 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0338  uroporphyrinogen-III synthase  26.75 
 
 
272 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.224423  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01871  putative uroporphyrinogen III synthase  25 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.773561  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0932  Uroporphyrinogen-III synthase  26.57 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1421  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  28.77 
 
 
492 aa  56.6  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16426  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1540  Uroporphyrinogen-III synthase  25 
 
 
249 aa  55.8  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221664  hitchhiker  0.00271946 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1106  uroporphyrinogen-III synthase  26.14 
 
 
266 aa  55.5  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000478387  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1687  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  28.71 
 
 
492 aa  55.1  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0805383  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1751  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.04 
 
 
260 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1278  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.38 
 
 
504 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.02 
 
 
491 aa  49.7  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3476  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.66 
 
 
270 aa  49.7  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0011  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.5 
 
 
271 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.458741 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2353  uroporphyrinogen-III synthase  24.27 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1792  uroporphyrinogen-III synthase  26.56 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.156972  normal  0.974342 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0736  uroporphyrinogen-III synthase  21.14 
 
 
259 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.512163 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2528  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  25.21 
 
 
493 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0043  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.71 
 
 
494 aa  47  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.655247  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2669  uroporphyrinogen-III synthase  21.98 
 
 
261 aa  46.6  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000490526 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01311  putative uroporphyrinogen III synthase  26.52 
 
 
265 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2178  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.35 
 
 
686 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.280216  hitchhiker  0.000563849 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0892  Uroporphyrinogen-III synthase  26.96 
 
 
245 aa  46.6  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0949  Uroporphyrinogen-III synthase  28.5 
 
 
247 aa  46.2  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1514  uroporphyrinogen-III synthase  24.15 
 
 
247 aa  46.2  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2031  uroporphyrinogen III synthase HEM4  21.43 
 
 
269 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.776715 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1797  uroporphyrinogen-III synthase  26.11 
 
 
251 aa  45.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0201801  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.11 
 
 
497 aa  45.4  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000345374  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01291  putative uroporphyrinogen III synthase  24.71 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.414645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0119  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.39 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0028  Uroporphyrinogen-III synthase  24.27 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1428  uroporphyrinogen-III synthase  25.6 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0482  uroporphyrinogen III synthase HEM4  21.86 
 
 
243 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1070  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.23 
 
 
672 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0493  uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.95 
 
 
267 aa  43.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>