90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2985 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2985  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 234 aa  462  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.202243  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1399  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  52.51 
 
 		 226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.110691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0619  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  34.93 
 
 		 607 aa  62.8  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0627947 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2069  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.32 
 
 		 522 aa  62  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.198087  hitchhiker  0.000347629 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24390  uroporphyrinogen-III synthase  34.62 
 
 		 558 aa  62  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0945  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.83 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349608  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5880  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.41 
 
 		 492 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1890  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.67 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0669  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  32.34 
 
 		 567 aa  59.7  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1015  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  31.4 
 
 		 577 aa  59.3  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6129  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.96 
 
 		 604 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143048  normal  0.442264 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0263  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  32.14 
 
 		 526 aa  58.9  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.240357  normal  0.829698 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2731  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  34.46 
 
 		 563 aa  58.9  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.510631  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0920  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  34.29 
 
 		 506 aa  58.5  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4438  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  34.09 
 
 		 526 aa  58.5  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6728  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  33.01 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10522  uroporphyrin-III C-methyltransferase hemD  28.68 
 
 		 565 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4370  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  32.95 
 
 		 562 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4578  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.23 
 
 		 516 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1346  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.57 
 
 		 511 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.694338  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0428  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.64 
 
 		 526 aa  56.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256746  hitchhiker  0.000733658 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0358  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.64 
 
 		 526 aa  56.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0116  putative uroporphyrinogen III synthase  23.39 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8324  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.88 
 
 		 594 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  27.46 
 
 		 520 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  28.63 
 
 		 513 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2353  uroporphyrinogen-III synthase  27.69 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02870  uroporphyrinogen-III synthase /uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  31.88 
 
 		 516 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.052713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0550  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen- III C-methyltransferase  33.14 
 
 		 526 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.746354  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0671  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  31.88 
 
 		 554 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01301  putative uroporphyrinogen III synthase  23.72 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3450  porphobilinogen deaminase  25.91 
 
 		 526 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.78794 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3476  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.15 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3438  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.34 
 
 		 362 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000446843  decreased coverage  0.00117344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1751  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.58 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.55 
 
 		 503 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0691  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  31.88 
 
 		 554 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.212228 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0678  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  31.88 
 
 		 554 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2449  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.06 
 
 		 502 aa  53.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.448467  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0251  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.19 
 
 		 490 aa  53.5  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0846  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.54 
 
 		 571 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.75971  normal  0.92956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0065  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.88 
 
 		 569 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255039  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.2 
 
 		 503 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2031  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.2 
 
 		 269 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.776715 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1376  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.58 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0236  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  33.85 
 
 		 528 aa  52.8  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0596  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.93 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0487  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  30.33 
 
 		 607 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.188044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0496  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  32.31 
 
 		 552 aa  52.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01291  putative uroporphyrinogen III synthase  28.05 
 
 		 282 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.414645 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01311  putative uroporphyrinogen III synthase  22.98 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0873  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.89 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2131  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.41 
 
 		 507 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0860734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3374  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.72 
 
 		 509 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.8 
 
 		 512 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1199  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.08 
 
 		 491 aa  50.1  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1555  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.61 
 
 		 545 aa  49.3  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  25.86 
 
 		 503 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01271  putative uroporphyrinogen III synthase  25.15 
 
 		 265 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.190532  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1228  uroporphyrinogen-III synthase  21.3 
 
 		 302 aa  48.9  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5697  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.06 
 
 		 527 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26181  putative uroporphyrinogen III synthase  25.19 
 
 		 277 aa  48.9  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1233  uroporphyrinogen-III synthase  24.76 
 
 		 226 aa  48.5  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0133688  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1543  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.9 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.741801  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1341  Uroporphyrinogen-III synthase  26.29 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3061  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.94 
 
 		 672 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2562  uroporphyrinogen-III synthase  24.31 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  23.36 
 
 		 505 aa  47.8  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.71 
 
 		 508 aa  47.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.63 
 
 		 511 aa  46.6  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2579  Uroporphyrinogen-III synthase  27.67 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3179  uroporphyrinogen-III synthase  24.64 
 
 		 252 aa  45.8  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2488  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  41.67 
 
 		 285 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000908937 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0185  uroporphyrinogen-III synthase  22.27 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1026  uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.26 
 
 		 264 aa  45.1  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.928762  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3549  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.44 
 
 		 266 aa  45.1  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2491  uroporphyrinogen-III synthase  32.19 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  24.81 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000190734  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.81 
 
 		 507 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.94 
 
 		 512 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12360  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.34 
 
 		 579 aa  43.1  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0439  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.08 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  22.49 
 
 		 516 aa  43.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2897  Uroporphyrinogen-III synthase  28.57 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.116607  normal  0.0810585 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44610  uroporphyrinogen-iii synthase  25.31 
 
 		 296 aa  42.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.20099  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3299  uroporphyrinogen-III synthase  28.57 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.466839  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.67 
 
 		 519 aa  42.4  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  32.5 
 
 		 513 aa  42  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.82 
 
 		 505 aa  42  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03635  Uroporphyrinogen-III synthase  27.18 
 
 		 217 aa  41.6  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.32733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>