42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1164 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1164  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 237 aa  472  1e-132  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.605795  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0218  uroporphyrinogen III synthase HEM4  39.66 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000144428  normal  0.0267075 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0896  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.46 
 
 		 506 aa  67.8  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0185  uroporphyrinogen-III synthase  33.33 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0338  uroporphyrinogen-III synthase  23.72 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.224423  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1482  putative uroporphyrinogen III synthase  26.8 
 
 		 266 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.360624  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.24 
 
 		 508 aa  57.4  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12360  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.29 
 
 		 579 aa  57  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2579  Uroporphyrinogen-III synthase  28.27 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3677  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.97 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1278  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.03 
 
 		 504 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.15 
 
 		 504 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  24.03 
 
 		 503 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11620  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.81 
 
 		 546 aa  52.4  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1199  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.9 
 
 		 491 aa  51.2  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.94 
 
 		 497 aa  51.2  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01871  putative uroporphyrinogen III synthase  26.02 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.773561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1901  uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.93 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.332563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4438  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  25.4 
 
 		 526 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1023  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.36 
 
 		 493 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2353  uroporphyrinogen-III synthase  21.51 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  25.57 
 
 		 516 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2897  Uroporphyrinogen-III synthase  23.53 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.116607  normal  0.0810585 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3299  uroporphyrinogen-III synthase  23.53 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.466839  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5880  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.18 
 
 		 492 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2562  uroporphyrinogen-III synthase  26.48 
 
 		 272 aa  45.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0236  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  25.21 
 
 		 528 aa  45.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4581  uroporphyrinogen-III synthase  29.15 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0653  uroporphyrinogen-III synthase  27.34 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2528  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  27.6 
 
 		 493 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.18 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2749  uroporphyrinogen-III synthase-like protein  35.59 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0640  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.57 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.44 
 
 		 512 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3179  uroporphyrinogen-III synthase  25.1 
 
 		 252 aa  42.4  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2731  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  24.9 
 
 		 563 aa  42.4  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.510631  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0116  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.7 
 
 		 215 aa  42  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.478002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.95 
 
 		 511 aa  42  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3476  uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.33 
 
 		 270 aa  42  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1015  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  26.47 
 
 		 577 aa  42  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.33 
 
 		 734 aa  41.6  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.5 
 
 		 505 aa  41.6  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>