17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0640 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0640  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 228 aa  457  9.999999999999999e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0185  uroporphyrinogen-III synthase  31.05 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2491  uroporphyrinogen-III synthase  25.26 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0708  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.91 
 
 		 464 aa  56.6  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1376  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.26 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1364  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.91 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.222114  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1461  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.91 
 
 		 264 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1751  uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.64 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2031  uroporphyrinogen III synthase HEM4  20.46 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.776715 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1023  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.97 
 
 		 493 aa  45.8  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0486  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.96 
 
 		 263 aa  45.1  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.473173 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0949  Uroporphyrinogen-III synthase  26.02 
 
 		 247 aa  45.1  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.62 
 
 		 497 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1341  Uroporphyrinogen-III synthase  23.14 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1164  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.57 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.605795  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3549  uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.08 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0202  uroporphyrinogen-III synthase HemD, putative  23.63 
 
 		 248 aa  42  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>