More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1847 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1847  methionine synthase (B12-dependent)  100 
 
 		 407 aa  843    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1961  methionine synthase  54.24 
 
 		 1253 aa  386  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.23883  hitchhiker  0.00552664 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0191  homocysteine S-methyltransferase  51.59 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4240  methionine synthase (B12-dependent)  51.73 
 
 		 359 aa  364  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.826519  normal  0.408833 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6259  methionine synthase (B12-dependent)  51.3 
 
 		 372 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0477  homocysteine S-methyltransferase  51.01 
 
 		 356 aa  358  7e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0783224 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2965  methionine synthase  51.59 
 
 		 355 aa  358  8e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2828  homocysteine S-methyltransferase  51.59 
 
 		 355 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2931  homocysteine S-methyltransferase  51.01 
 
 		 355 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2302  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  51.01 
 
 		 355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2916  methionine synthase  51.01 
 
 		 355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142976  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0083  methionine synthase (B12-dependent)  52.44 
 
 		 366 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0358  homocysteine S-methyltransferase, putative  50.29 
 
 		 358 aa  355  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1345  B12-dependent homocysteine-N5-methyltetrahydrofolate transmethylase, repressor of metE and metF  50.29 
 
 		 359 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0249  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  50.29 
 
 		 359 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.481246  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0595  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  50.29 
 
 		 359 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.780468  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0434  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  50.29 
 
 		 359 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.808444  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3218  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  50.29 
 
 		 359 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0414  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  50.29 
 
 		 359 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0102  homocysteine S-methyltransferase  51.86 
 
 		 344 aa  352  5e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0388  homocysteine S-methyltransferase  50.72 
 
 		 367 aa  352  8e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0207088 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0172  methionine synthase (B12-dependent)  50.72 
 
 		 348 aa  345  7e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.727422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0460  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  49.86 
 
 		 348 aa  345  1e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0118  methionine synthase (B12-dependent)  48.42 
 
 		 351 aa  342  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2509  B12-dependent methionine synthase  47.99 
 
 		 1262 aa  343  5e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0087  methionine synthase (B12-dependent)  48.14 
 
 		 355 aa  341  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.398145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  48.48 
 
 		 1267 aa  340  2e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0167  homocysteine S-methyltransferase  49.58 
 
 		 348 aa  338  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1689  homocysteine S-methyltransferase  49.01 
 
 		 354 aa  338  9.999999999999999e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0115  homocysteine S-methyltransferase  49.29 
 
 		 351 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.165107 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0156  homocysteine S-methyltransferase  48.84 
 
 		 346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  48.3 
 
 		 1250 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0169  homocysteine S-methyltransferase  47.98 
 
 		 368 aa  335  7e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0295  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  47.98 
 
 		 346 aa  335  7.999999999999999e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0149  homocysteine S-methyltransferase  48.55 
 
 		 346 aa  335  7.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.637039 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  49.59 
 
 		 1236 aa  335  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  47.78 
 
 		 1232 aa  335  1e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  46.94 
 
 		 1232 aa  334  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1195  methionine synthase  46.91 
 
 		 370 aa  333  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0174  methionine synthase (B12-dependent)  49.3 
 
 		 354 aa  333  4e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.600189  hitchhiker  0.00922772 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0234  B12-dependent methionine synthase  48.65 
 
 		 1237 aa  331  1e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.545849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  46.88 
 
 		 1236 aa  331  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1980  methionine synthase  48.16 
 
 		 354 aa  331  1e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  48.28 
 
 		 1238 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  47.22 
 
 		 1226 aa  325  9e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1030  B12-dependent methionine synthase  48.31 
 
 		 1244 aa  325  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3268  homocysteine S-methyltransferase  48.13 
 
 		 357 aa  325  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0164152 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3184  B12-dependent methionine synthase  48.02 
 
 		 1244 aa  323  4e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  42.32 
 
 		 1278 aa  322  6e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0166  methionine synthase (B12-dependent)  48.16 
 
 		 357 aa  322  6e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3449  B12-dependent methionine synthase  45.74 
 
 		 1234 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40670  B12-dependent methionine synthase  45.74 
 
 		 1234 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0754274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  47.18 
 
 		 1244 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3775  B12-dependent methionine synthase  46.59 
 
 		 1227 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0838  B12-dependent methionine synthase  47.74 
 
 		 1244 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  46.02 
 
 		 1245 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  46.15 
 
 		 1245 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3951  B12-dependent methionine synthase  46.02 
 
 		 1227 aa  319  5e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360627  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  46.93 
 
 		 1251 aa  319  5e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2144  methionine synthase  46.37 
 
 		 1243 aa  318  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.212238  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2611  homocysteine S-methyltransferase  46.51 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.186281 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1888  B12-dependent methionine synthase  44.82 
 
 		 1235 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  45.35 
 
 		 1226 aa  317  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1982  B12-dependent methionine synthase  44.54 
 
 		 1235 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0368395  normal  0.238169 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  46.2 
 
 		 1263 aa  317  3e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0113  B12-dependent methionine synthase  45.17 
 
 		 1227 aa  316  5e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3107  B12-dependent methionine synthase  44.89 
 
 		 1236 aa  316  6e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  44.54 
 
 		 1235 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2965  B12-dependent methionine synthase  46.33 
 
 		 1244 aa  315  7e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  44.54 
 
 		 1235 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  46.15 
 
 		 1241 aa  315  9e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  46.02 
 
 		 1230 aa  315  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03712  B12-dependent methionine synthase  44.63 
 
 		 1226 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0973  B12-dependent methionine synthase  46.33 
 
 		 1244 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1508  homocysteine S-methyltransferase  45.92 
 
 		 334 aa  312  7.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2732  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  44.25 
 
 		 1239 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0346659  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  46.09 
 
 		 1264 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  45.82 
 
 		 1228 aa  310  2e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  45.8 
 
 		 1237 aa  310  2e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0995  B12-dependent methionine synthase  46.33 
 
 		 1244 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0391552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2464  B12-dependent methionine synthase  44.25 
 
 		 1239 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.782684  normal  0.0191622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3368  B12-dependent methionine synthase  46.05 
 
 		 1233 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  46.09 
 
 		 1264 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2169  methionine synthase  45.15 
 
 		 1245 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.205577  normal  0.226732 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1007  B12-dependent methionine synthase  45.76 
 
 		 1244 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2402  homocysteine S-methyltransferase  45.9 
 
 		 353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264872  normal  0.0639264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4224  B12-dependent methionine synthase  46.31 
 
 		 1293 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572954  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2010  B12-dependent methionine synthase  45.4 
 
 		 1233 aa  309  5e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2671  methionine synthase  46.22 
 
 		 1269 aa  309  6.999999999999999e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0442  B12-dependent methionine synthase  45.33 
 
 		 1226 aa  308  8e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01233  methionine synthase  45.28 
 
 		 379 aa  308  8e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0459633  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  47.21 
 
 		 1249 aa  308  8e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0710  B12-dependent methionine synthase  47.2 
 
 		 1240 aa  308  9e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3545  B12-dependent methionine synthase  46.8 
 
 		 1245 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.229259 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0657  methionine synthase  45.22 
 
 		 1238 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0892  homocysteine S-methyltransferase  46.18 
 
 		 339 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  45.9 
 
 		 1228 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2631  B12-dependent methionine synthase  44.85 
 
 		 1244 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0960245  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4401  B12-dependent methionine synthase  44.54 
 
 		 1227 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.90979  normal  0.334358 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0758  B12-dependent methionine synthase  43.05 
 
 		 1246 aa  306  3e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.659122  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>