More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0169 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0169  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 368 aa  759    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0174  methionine synthase (B12-dependent)  85.71 
 
 		 354 aa  617  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.600189  hitchhiker  0.00922772 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0102  homocysteine S-methyltransferase  83.05 
 
 		 344 aa  607  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0083  methionine synthase (B12-dependent)  82.82 
 
 		 366 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1195  methionine synthase  79.66 
 
 		 370 aa  595  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0115  homocysteine S-methyltransferase  77.9 
 
 		 351 aa  570  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.165107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0167  homocysteine S-methyltransferase  79.89 
 
 		 348 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0172  methionine synthase (B12-dependent)  77.12 
 
 		 348 aa  565  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.727422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0460  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  76.82 
 
 		 348 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0156  homocysteine S-methyltransferase  74.78 
 
 		 346 aa  521  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0149  homocysteine S-methyltransferase  74.49 
 
 		 346 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.637039 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0295  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  73.9 
 
 		 346 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0191  homocysteine S-methyltransferase  72.81 
 
 		 356 aa  511  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0477  homocysteine S-methyltransferase  71.93 
 
 		 356 aa  508  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0783224 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6259  methionine synthase (B12-dependent)  68.06 
 
 		 372 aa  508  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2828  homocysteine S-methyltransferase  70 
 
 		 355 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0087  methionine synthase (B12-dependent)  73.02 
 
 		 355 aa  510  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.398145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2965  methionine synthase  69.71 
 
 		 355 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0388  homocysteine S-methyltransferase  70.76 
 
 		 367 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0207088 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2931  homocysteine S-methyltransferase  69.43 
 
 		 355 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2302  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  69.43 
 
 		 355 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2916  methionine synthase  69.43 
 
 		 355 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142976  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0166  methionine synthase (B12-dependent)  71.97 
 
 		 357 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4240  methionine synthase (B12-dependent)  71.26 
 
 		 359 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.826519  normal  0.408833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3268  homocysteine S-methyltransferase  69.1 
 
 		 357 aa  499  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0164152 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0358  homocysteine S-methyltransferase, putative  70.18 
 
 		 358 aa  500  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0249  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  69.59 
 
 		 359 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.481246  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0118  methionine synthase (B12-dependent)  70.92 
 
 		 351 aa  498  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0595  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  69.59 
 
 		 359 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.780468  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0414  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  69.59 
 
 		 359 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1345  B12-dependent homocysteine-N5-methyltetrahydrofolate transmethylase, repressor of metE and metF  69.59 
 
 		 359 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3218  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  69.59 
 
 		 359 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0434  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  69.59 
 
 		 359 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.808444  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1689  homocysteine S-methyltransferase  68.8 
 
 		 354 aa  494  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1980  methionine synthase  68.68 
 
 		 354 aa  488  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2509  B12-dependent methionine synthase  67.73 
 
 		 1262 aa  476  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  59.77 
 
 		 1267 aa  428  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  60.47 
 
 		 1245 aa  421  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  60.59 
 
 		 1238 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  58.96 
 
 		 1263 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  59.47 
 
 		 1232 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  61.06 
 
 		 1241 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  55.97 
 
 		 1245 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40670  B12-dependent methionine synthase  58.64 
 
 		 1234 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0754274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  58.28 
 
 		 1251 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  58.14 
 
 		 1237 aa  402  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3449  B12-dependent methionine synthase  58.36 
 
 		 1234 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625644  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0710  B12-dependent methionine synthase  59.76 
 
 		 1240 aa  404  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2402  homocysteine S-methyltransferase  61.18 
 
 		 353 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264872  normal  0.0639264 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  58.77 
 
 		 1236 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0234  B12-dependent methionine synthase  58.36 
 
 		 1237 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.545849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3951  B12-dependent methionine synthase  58.72 
 
 		 1227 aa  401  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360627  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3184  B12-dependent methionine synthase  60.42 
 
 		 1244 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  58.02 
 
 		 1278 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2631  B12-dependent methionine synthase  57.26 
 
 		 1244 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0960245  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1030  B12-dependent methionine synthase  59 
 
 		 1244 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0973  B12-dependent methionine synthase  57.42 
 
 		 1244 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3775  B12-dependent methionine synthase  58.43 
 
 		 1227 aa  397  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0995  B12-dependent methionine synthase  57.42 
 
 		 1244 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0391552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1007  B12-dependent methionine synthase  57.14 
 
 		 1244 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1982  B12-dependent methionine synthase  57.59 
 
 		 1235 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0368395  normal  0.238169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1888  B12-dependent methionine synthase  58.02 
 
 		 1235 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2965  B12-dependent methionine synthase  57.14 
 
 		 1244 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0838  B12-dependent methionine synthase  59.82 
 
 		 1244 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2671  methionine synthase  59.94 
 
 		 1269 aa  396  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  59.82 
 
 		 1244 aa  395  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3368  B12-dependent methionine synthase  59.29 
 
 		 1233 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1526  B12-dependent methionine synthase  56.1 
 
 		 1232 aa  395  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  57.59 
 
 		 1235 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3107  B12-dependent methionine synthase  57.85 
 
 		 1236 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  57.59 
 
 		 1235 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  55.26 
 
 		 1228 aa  391  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2144  methionine synthase  55.62 
 
 		 1243 aa  393  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.212238  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2732  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  57.27 
 
 		 1239 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0346659  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2464  B12-dependent methionine synthase  58.33 
 
 		 1239 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.782684  normal  0.0191622 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3053  B12-dependent methionine synthase  58.04 
 
 		 1251 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.453999 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2832  B12-dependent methionine synthase  57.63 
 
 		 1271 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.192266 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01233  methionine synthase  55.43 
 
 		 379 aa  389  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0459633  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0758  B12-dependent methionine synthase  56.85 
 
 		 1246 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.659122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4250  methionine synthase  55.91 
 
 		 1261 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  56.56 
 
 		 1250 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0046  B12-dependent methionine synthase  55.07 
 
 		 1220 aa  385  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.61869 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  55.68 
 
 		 1232 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2010  B12-dependent methionine synthase  56.56 
 
 		 1233 aa  387  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2611  homocysteine S-methyltransferase  56.63 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.186281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  54.87 
 
 		 1274 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  56.42 
 
 		 1230 aa  383  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  55.3 
 
 		 1239 aa  382  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  58.26 
 
 		 1247 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  56.8 
 
 		 1264 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  56.8 
 
 		 1264 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0368  B12-dependent methionine synthase  55.52 
 
 		 1231 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0892  homocysteine S-methyltransferase  56.73 
 
 		 339 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4088  B12-dependent methionine synthase  57.27 
 
 		 1251 aa  378  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3739  B12-dependent methionine synthase  58.38 
 
 		 1252 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4224  B12-dependent methionine synthase  56.01 
 
 		 1293 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572954  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3545  B12-dependent methionine synthase  57.31 
 
 		 1245 aa  378  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.229259 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3923  B12-dependent methionine synthase  55.52 
 
 		 1230 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  54.55 
 
 		 1226 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  54.36 
 
 		 1227 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>