More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3550 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3550  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 325 aa  650    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3538  transcriptional regulator, LysR family  36.9 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1227  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.268765  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3833  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5485  transcriptional regulator LysR family  33.44 
 
 		 318 aa  149  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.781611  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4024  transcriptional regulator, LysR family  33.99 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.715762  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2802  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 305 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6227  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.05 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896126  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3196  nodulation protein d1  34.59 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  36 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3423  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0556291  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4833  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939705 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4915  transcriptional regulator, LysR family  30.92 
 
 		 315 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6212  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4532  transcriptional regulator, LysR family  35.18 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4664  transcriptional regulator, LysR family  35.18 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0610677 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5941  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.122613 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 307 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 308 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0846  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3057  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.061728 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03220  Transcriptional regulator  31.05 
 
 		 347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6183  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 311 aa  132  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.543426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 432 aa  132  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0352  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 299 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1036  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 320 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0902  transcriptional regulator, LysR family  36.14 
 
 		 321 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0163  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  26.58 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2042  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.557762  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 317 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2635  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2956  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4276  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_003296  RS01757  transcription regulator transcription regulator protein  34.44 
 
 		 321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.354836 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4339  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.67 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1973  LysR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1932  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.795465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0853  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255595  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2978  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0300552 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2826  transcriptional regulator MexT  33.87 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3262  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2863  LysR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3434  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 333 aa  127  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5101  LysR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.428224  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2201  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 300 aa  126  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00946947 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2305  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 316 aa  126  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089985 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 305 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0866  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 299 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 309 aa  125  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5073  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.255466 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0737  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210121 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532671 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5115  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337357  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2824  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4108  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7723  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.262185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2222  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.176511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  30.49 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 331 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4479  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2183  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 304 aa  123  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.0364497 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2913  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.11 
 
 		 304 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0160728 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.43 
 
 		 300 aa  123  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4744  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 314 aa  123  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3131  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3040  transcriptional regulator, LysR family  33.88 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120446  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3336  transcriptional regulator, LysR family  32.9 
 
 		 306 aa  122  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.347566 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 306 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3156  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 308 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  35.08 
 
 		 298 aa  122  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  30.84 
 
 		 304 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2235  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 314 aa  122  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.130762  decreased coverage  0.000140411 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2666  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 304 aa  122  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 309 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 306 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1535  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 301 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418397  hitchhiker  0.00238453 
 
 
-
 
NC_003296  RS01658  transcriptional regulator transcription regulator protein  34.11 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5035  transcriptional regulator, LysR family  30.66 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.776496  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  30.72 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2746  transcriptional regulator MexT  34.88 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5015  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32410  transcriptional regulator MexT  34.88 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282605  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0144  transcription regulator protein  33.89 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 329 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  28.21 
 
 		 314 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5932  putative transcriptional regulator  32.76 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>