233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1288 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1288  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 318 aa  644    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.405144  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0030  radical SAM domain-containing protein  56.91 
 
 		 312 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0482  radical SAM domain-containing protein  54.49 
 
 		 329 aa  342  4e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0812  radical SAM domain-containing protein  53.21 
 
 		 311 aa  335  7e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0789  radical SAM domain-containing protein  53.21 
 
 		 311 aa  335  7e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0823  Fe-S-cluster redox enzyme-like protein  29.03 
 
 		 322 aa  102  8e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000997215  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1012  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  32.4 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18821  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  31.84 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0164  radical SAM enzyme, Cfr family  24.31 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  23.64 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  27.73 
 
 		 371 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4731  radical SAM enzyme, Cfr family  29.26 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.698724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0409  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  21.82 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.112692  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1361  radical SAM enzyme, Cfr family  23.05 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2063  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  25.46 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.029616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1427  radical SAM enzyme, Cfr family  26.62 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  25.58 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.164087  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3577  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  22.73 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4986  radical SAM enzyme, Cfr family  24.29 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.323052  hitchhiker  0.00454129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3404  radical SAM enzyme, Cfr family  21.38 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00306025  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0683  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  22.35 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.882739  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23560  radical SAM enzyme, Cfr family  23.88 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10170  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  22.98 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2223  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  21.4 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522742  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4121  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  22.01 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  30.86 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3850  radical SAM enzyme, Cfr family  23.35 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0426  radical SAM enzyme, Cfr family  24.31 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0951  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  23.87 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1204  radical SAM enzyme, Cfr family  28.07 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110623 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  24.22 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2178  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  20 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0846545  hitchhiker  0.000495188 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  27.04 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00249025 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1508  radical SAM enzyme, Cfr family  29.53 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.868502  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  22.81 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1087  radical SAM enzyme, Cfr family  24.68 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486861  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1167  radical SAM protein  24.68 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2502  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  22.73 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293735  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3855  radical SAM enzyme, Cfr family  31.11 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.74079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5902  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  20.83 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1172  radical SAM protein  25.99 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40320  hypothetical protein  23.87 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0928  radical SAM enzyme, Cfr family  24.26 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.947592  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1503  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  27.6 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.578618  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1489  radical SAM enzyme, Cfr family  25.99 
 
 		 375 aa  57  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1009  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  23.48 
 
 		 376 aa  57  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.834278 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16031  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  27.44 
 
 		 356 aa  57  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1905  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  25.28 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0212666  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2928  radical SAM protein  28.98 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.333944  normal  0.253326 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1386  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  27.5 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.530912  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1678  radical SAM enzyme, Cfr family  21.66 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30965  predicted protein  28.8 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.747034  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3677  radical SAM enzyme, Cfr family  21.97 
 
 		 365 aa  55.8  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09960  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  20.9 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.434962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2180  radical SAM protein  28.14 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1245  hypothetical protein  23.18 
 
 		 382 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1000  radical SAM enzyme, Cfr family  23.83 
 
 		 388 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.189733  normal  0.570497 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5856  radical SAM enzyme, Cfr family  24.48 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2203  radical SAM enzyme, Cfr family  21.09 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00426672  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2012  radical SAM enzyme, Cfr family  24.89 
 
 		 357 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1869  radical SAM protein  21.03 
 
 		 374 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2114  radical SAM enzyme, Cfr family  21.93 
 
 		 368 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4305  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.11 
 
 		 363 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16611  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  27.06 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.785393  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04411  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.52 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  25.78 
 
 		 349 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1308  hypothetical protein  22.19 
 
 		 378 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1431  radical SAM enzyme, Cfr family  22.84 
 
 		 382 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14830  hypothetical protein  22.19 
 
 		 379 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0427  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  28.16 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273579  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4328  radical SAM protein  24.05 
 
 		 381 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000214748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  22.35 
 
 		 395 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0799869 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0083  radical SAM protein  28.57 
 
 		 391 aa  53.9  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1327  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  19.4 
 
 		 353 aa  53.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  25.52 
 
 		 367 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_4583  predicted protein  27.38 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0726  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  25.25 
 
 		 383 aa  52.8  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  22.26 
 
 		 430 aa  53.1  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1421  radical SAM protein  23.4 
 
 		 373 aa  53.1  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  23.08 
 
 		 359 aa  52.8  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1420  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  22.1 
 
 		 391 aa  52.8  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0340942  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1631  hypothetical protein  25.89 
 
 		 372 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.212269  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0850  radical SAM enzyme, Cfr family  24.05 
 
 		 381 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2221  chloramphenicol/florfenicol resistance protein  30.43 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1743  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  27.5 
 
 		 358 aa  52  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.499617  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0596  radical SAM enzyme, Cfr family  22.96 
 
 		 353 aa  52  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2317  radical SAM enzyme, Cfr family  26.4 
 
 		 372 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2229  radical SAM enzyme, Cfr family  26.4 
 
 		 372 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004351  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  25.16 
 
 		 375 aa  52  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.75 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0880  radical SAM protein  24.05 
 
 		 381 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.588351  normal  0.297118 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0893  radical SAM protein  24.05 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000355307 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  26.13 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4604  hypothetical protein  22.64 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  21.18 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3613  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.31 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0340867 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  26.04 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0286  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.09 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0016411  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1056  radical SAM enzyme, Cfr family  29.41 
 
 		 383 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0486076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1353  radical SAM protein  24.25 
 
 		 371 aa  50.8  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>