292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0823 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0823  Fe-S-cluster redox enzyme-like protein  100 
 
 
322 aa  662    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000997215  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0482  radical SAM domain-containing protein  30.67 
 
 
329 aa  117  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0789  radical SAM domain-containing protein  30.9 
 
 
311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0812  radical SAM domain-containing protein  30.9 
 
 
311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0030  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 
312 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1288  Radical SAM domain protein  29.03 
 
 
318 aa  102  9e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.405144  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1905  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  23.49 
 
 
347 aa  64.3  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0212666  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2022  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.35 
 
 
371 aa  62.8  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1816  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  25.45 
 
 
354 aa  62.8  0.000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1503  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  27.27 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.578618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02409  predicted enzyme  35.56 
 
 
384 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1151  radical SAM enzyme, Cfr family  35.56 
 
 
384 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.390398  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2801  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.56 
 
 
384 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1160  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.56 
 
 
384 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0206768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2669  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.56 
 
 
384 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.253648 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3742  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.56 
 
 
384 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2892  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.56 
 
 
384 aa  60.5  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02371  hypothetical protein  35.56 
 
 
384 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5856  radical SAM enzyme, Cfr family  30.56 
 
 
378 aa  60.1  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2677  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.11 
 
 
388 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2783  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.11 
 
 
388 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.355164  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2895  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.11 
 
 
388 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2720  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.11 
 
 
388 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.564025  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2764  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.11 
 
 
388 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0850  radical SAM enzyme, Cfr family  38.71 
 
 
381 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2740  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.11 
 
 
393 aa  59.7  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  26.56 
 
 
371 aa  60.1  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0164  radical SAM enzyme, Cfr family  24.11 
 
 
353 aa  59.7  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0893  radical SAM protein  38.71 
 
 
381 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000355307 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1165  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.47 
 
 
372 aa  60.1  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665651  normal  0.505082 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  33.33 
 
 
359 aa  59.7  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0880  radical SAM protein  38.71 
 
 
381 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.588351  normal  0.297118 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1508  radical SAM enzyme, Cfr family  37.93 
 
 
359 aa  59.7  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.868502  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2223  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  28.38 
 
 
365 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522742  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1743  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  26.73 
 
 
358 aa  59.3  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.499617  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4328  radical SAM protein  37.63 
 
 
381 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000214748 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1115  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.11 
 
 
392 aa  58.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2685  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.29 
 
 
346 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000061721  normal  0.591184 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2668  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.56 
 
 
384 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  30.4 
 
 
355 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00249025 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  31.58 
 
 
367 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1111  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.52 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3610  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  26.88 
 
 
351 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3017  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.11 
 
 
419 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1353  radical SAM protein  37.36 
 
 
371 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000160208 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1255  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.11 
 
 
400 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  27.17 
 
 
341 aa  57.4  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  37.5 
 
 
382 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.3 
 
 
373 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.563776  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  32.98 
 
 
366 aa  57  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  37.5 
 
 
382 aa  57  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1699  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.41 
 
 
348 aa  57  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  36.26 
 
 
364 aa  57  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0633  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  21.36 
 
 
344 aa  57  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.04 
 
 
388 aa  57  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1678  radical SAM enzyme, Cfr family  25.13 
 
 
371 aa  56.6  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  23.32 
 
 
348 aa  56.6  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1000  radical SAM enzyme, Cfr family  35.96 
 
 
388 aa  56.6  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.189733  normal  0.570497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1869  radical SAM protein  33.71 
 
 
374 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.42 
 
 
372 aa  55.8  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000522962  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2993  radical SAM protein  21.81 
 
 
356 aa  55.8  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00523882  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1442  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  33.7 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2203  radical SAM enzyme, Cfr family  34.12 
 
 
388 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00426672  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0928  radical SAM enzyme, Cfr family  37.5 
 
 
364 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.947592  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1623  hypothetical protein  37.36 
 
 
362 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271207 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1468  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  33.7 
 
 
340 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3404  radical SAM enzyme, Cfr family  32.58 
 
 
388 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00306025  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2558  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  23.92 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.150479999999999e-35 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0409  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.07 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.112692  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2502  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.44 
 
 
383 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293735  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2543  radical SAM enzyme, Cfr family  33.33 
 
 
383 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180565  hitchhiker  0.00648935 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3129  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.04 
 
 
380 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  23.92 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0167472  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1225  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  32.17 
 
 
373 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.461537  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1296  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  32.17 
 
 
373 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499019  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3503  radical SAM protein  33.33 
 
 
382 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1539  radical SAM protein  29.79 
 
 
363 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.177286  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1166  radical SAM enzyme, Cfr family  31.3 
 
 
359 aa  55.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.565735 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3612  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  33.33 
 
 
398 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.172682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1581  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.04 
 
 
343 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000011547  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5902  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.16 
 
 
368 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1308  hypothetical protein  25.81 
 
 
378 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0421  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  33.33 
 
 
398 aa  53.9  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.662236  hitchhiker  0.00298691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2114  radical SAM enzyme, Cfr family  25.65 
 
 
368 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.09 
 
 
361 aa  54.3  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4121  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.52 
 
 
365 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1721  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.91 
 
 
354 aa  53.9  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.428537  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1541  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.17 
 
 
373 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.865101  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2178  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  32.98 
 
 
372 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0846545  hitchhiker  0.000495188 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1892  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  25.81 
 
 
381 aa  54.3  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1183  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  33.33 
 
 
398 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1198  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  33.33 
 
 
365 aa  53.9  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.347563  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  21.76 
 
 
343 aa  53.9  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1226  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  30.43 
 
 
373 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173043  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  33.71 
 
 
395 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0799869 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1290  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  33.33 
 
 
398 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0021  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  27.59 
 
 
356 aa  54.3  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01053  radical SAM enzyme, Cfr family  34.07 
 
 
393 aa  53.9  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.184624  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3151  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.17 
 
 
373 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00905599  hitchhiker  0.00812914 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18821  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.88 
 
 
359 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>