275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0030 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0030  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 312 aa  637    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0789  radical SAM domain-containing protein  71.06 
 
 		 311 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0812  radical SAM domain-containing protein  71.06 
 
 		 311 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0482  radical SAM domain-containing protein  66.88 
 
 		 329 aa  441  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1288  Radical SAM domain protein  56.91 
 
 		 318 aa  352  2.9999999999999997e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.405144  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0823  Fe-S-cluster redox enzyme-like protein  32.26 
 
 		 322 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000997215  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  26.89 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1172  radical SAM protein  26.3 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1012  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  28.98 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18821  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  28.98 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1427  radical SAM enzyme, Cfr family  29.02 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2804  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  30.61 
 
 		 355 aa  75.9  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.745253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  25.52 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1539  radical SAM protein  27.66 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.177286  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04411  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  28.96 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  25.37 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  26.52 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3577  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  22.83 
 
 		 421 aa  72.8  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0906  radical SAM enzyme, Cfr family  30.1 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16611  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  28.47 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.785393  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  25.45 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1574  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  31.72 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  26.94 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3237  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  26.32 
 
 		 376 aa  68.9  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0633  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  25.37 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0059  radical SAM enzyme, Cfr family  24.75 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.955574  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  25 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  25.29 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  30.15 
 
 		 361 aa  67  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.05 
 
 		 395 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0799869 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12087  predicted protein  28.97 
 
 		 340 aa  67  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0164  radical SAM enzyme, Cfr family  24.81 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  22.73 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.164087  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3850  radical SAM enzyme, Cfr family  25.56 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16851  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  29.89 
 
 		 348 aa  65.9  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1905  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.83 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0212666  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0683  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  23.77 
 
 		 365 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.882739  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2063  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  26.88 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.029616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4731  radical SAM enzyme, Cfr family  27.23 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.698724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1000  radical SAM enzyme, Cfr family  24.13 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.189733  normal  0.570497 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16031  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  25.7 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3677  radical SAM enzyme, Cfr family  24.43 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16721  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  30.32 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  27.55 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00249025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2114  radical SAM enzyme, Cfr family  24.62 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1743  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.2 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.499617  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3404  radical SAM enzyme, Cfr family  23.49 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00306025  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1508  radical SAM enzyme, Cfr family  27.47 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.868502  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  26.44 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1699  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  23.65 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49687  predicted protein  30.64 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.622489 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2178  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  22.45 
 
 		 372 aa  62.8  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0846545  hitchhiker  0.000495188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3855  radical SAM enzyme, Cfr family  33.95 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.74079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3613  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  26.3 
 
 		 352 aa  62.4  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0340867 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  24.63 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0928  radical SAM enzyme, Cfr family  31.37 
 
 		 364 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.947592  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23560  radical SAM enzyme, Cfr family  24.34 
 
 		 364 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1166  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  23.08 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.800858  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1327  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  23.21 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  25.71 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2012  radical SAM enzyme, Cfr family  23.87 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0427  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  30.96 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273579  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  23.79 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3745  radical SAM enzyme, Cfr family  22.54 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  decreased coverage  0.00432991 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  24.52 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1235  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  23.76 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478405  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2155  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  29.36 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00348508  normal  0.317222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2685  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  25.9 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000061721  normal  0.591184 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2093  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  25.97 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1361  radical SAM enzyme, Cfr family  24.18 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  25.59 
 
 		 369 aa  58.9  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1336  radical SAM family enzyme  25.56 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1503  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  29.95 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.578618  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0426  radical SAM enzyme, Cfr family  25.59 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1869  radical SAM protein  23.28 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4986  radical SAM enzyme, Cfr family  25.18 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.323052  hitchhiker  0.00454129 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1043  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  25.24 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1397  radical SAM protein  25.56 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.724249  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  24.92 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  24.92 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_4583  predicted protein  23.02 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2022  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  23.02 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2783  radical SAM enzyme, Cfr family  27.08 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1414  radical SAM enzyme, Cfr family  25.35 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1227  hypothetical protein  24.55 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.75541  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1204  radical SAM enzyme, Cfr family  30.43 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3503  radical SAM protein  24.14 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1166  radical SAM enzyme, Cfr family  25.68 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.565735 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1386  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  30.51 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.530912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2223  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  23.46 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522742  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1892  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  25.18 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1489  radical SAM enzyme, Cfr family  23.44 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1721  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  26.92 
 
 		 354 aa  57  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.428537  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2203  radical SAM enzyme, Cfr family  24.01 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00426672  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  23.61 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3453  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  25.81 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0083  radical SAM protein  23.79 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1111  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  25.93 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07736  hypothetical protein  26.61 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2502  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.01 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293735  normal  0.506779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>