More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1536 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  100 
 
 		 430 aa  856    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1000  radical SAM enzyme, Cfr family  69.54 
 
 		 388 aa  500  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.189733  normal  0.570497 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0683  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  66.4 
 
 		 365 aa  482  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.882739  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3404  radical SAM enzyme, Cfr family  66.84 
 
 		 388 aa  484  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  64.17 
 
 		 395 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0799869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1869  radical SAM protein  64.36 
 
 		 374 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09960  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  63.78 
 
 		 370 aa  462  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.434962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1678  radical SAM enzyme, Cfr family  63.34 
 
 		 371 aa  464  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3677  radical SAM enzyme, Cfr family  63.88 
 
 		 365 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3237  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  62.43 
 
 		 376 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1327  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  65.23 
 
 		 353 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2114  radical SAM enzyme, Cfr family  63.03 
 
 		 368 aa  451  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1235  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  64.15 
 
 		 380 aa  444  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478405  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5902  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  61.7 
 
 		 368 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2502  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  61.62 
 
 		 383 aa  435  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293735  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2178  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  63.56 
 
 		 372 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0846545  hitchhiker  0.000495188 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1009  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.74 
 
 		 376 aa  431  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.834278 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3577  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  60.68 
 
 		 421 aa  427  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4121  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  60.11 
 
 		 365 aa  424  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1420  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  59.04 
 
 		 391 aa  422  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0340942  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2203  radical SAM enzyme, Cfr family  59.1 
 
 		 388 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00426672  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2223  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  60.11 
 
 		 365 aa  423  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522742  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1489  radical SAM enzyme, Cfr family  59.03 
 
 		 375 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23560  radical SAM enzyme, Cfr family  58.24 
 
 		 364 aa  421  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21300  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  55.56 
 
 		 465 aa  416  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.830404  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11240  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  53.33 
 
 		 426 aa  416  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.43214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12894  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  58.76 
 
 		 364 aa  412  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.942196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3980  radical SAM enzyme, Cfr family  63.03 
 
 		 395 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2006  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  59.84 
 
 		 374 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578114  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2052  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  59.84 
 
 		 374 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1987  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  59.84 
 
 		 374 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0876088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10170  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  55 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1166  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  62.08 
 
 		 385 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.800858  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1185  radical SAM enzyme, Cfr family  53.95 
 
 		 389 aa  387  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0409  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  52.39 
 
 		 389 aa  383  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.112692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4305  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.28 
 
 		 363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0286  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.61 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3583  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.36 
 
 		 399 aa  281  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1376  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.75 
 
 		 399 aa  280  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  42.12 
 
 		 371 aa  278  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0164  radical SAM enzyme, Cfr family  48.01 
 
 		 353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  45.58 
 
 		 354 aa  272  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  37.99 
 
 		 348 aa  261  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  40.16 
 
 		 349 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.27 
 
 		 355 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00249025 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  39.34 
 
 		 351 aa  246  4e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1421  radical SAM protein  40.52 
 
 		 373 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2191  radical SAM enzyme, Cfr family  39.7 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.37 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  42.2 
 
 		 342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  41.01 
 
 		 377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1711  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.1 
 
 		 347 aa  243  5e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294696  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2783  radical SAM enzyme, Cfr family  42.05 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5022  radical SAM protein  41.1 
 
 		 397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  39.25 
 
 		 356 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1167  radical SAM protein  40.36 
 
 		 374 aa  238  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3850  radical SAM enzyme, Cfr family  38.98 
 
 		 357 aa  237  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  41.19 
 
 		 369 aa  237  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  42.62 
 
 		 359 aa  237  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2871  radical SAM protein  42.32 
 
 		 393 aa  237  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2310  hypothetical protein  40.05 
 
 		 382 aa  236  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1087  radical SAM enzyme, Cfr family  40.36 
 
 		 383 aa  237  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486861  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  40.35 
 
 		 344 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.42 
 
 		 342 aa  236  6e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1249  radical SAM protein  40.78 
 
 		 360 aa  236  7e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.61 
 
 		 349 aa  236  8e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.11 
 
 		 365 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.03 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  39.31 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1323  radical SAM enzyme, Cfr family  40.37 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.67 
 
 		 362 aa  233  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.67 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.67 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.67 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.67 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.67 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.67 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2310  radical SAM enzyme, Cfr family  38.52 
 
 		 349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0772545  hitchhiker  0.000694436 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  41.14 
 
 		 366 aa  233  5e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  41.19 
 
 		 376 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1338  radical SAM enzyme, Cfr family  36.65 
 
 		 351 aa  233  6e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0802459  normal  0.737261 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  39.74 
 
 		 375 aa  233  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.67 
 
 		 362 aa  232  9e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0648  hypothetical protein  36.83 
 
 		 413 aa  232  9e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0679  hypothetical protein  36.57 
 
 		 409 aa  231  1e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1657  radical SAM enzyme, Cfr family  39.33 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.33058  normal  0.466299 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1388  radical SAM enzyme, Cfr family  39.84 
 
 		 462 aa  231  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126812  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1590  radical SAM protein  43.9 
 
 		 318 aa  230  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3393  radical SAM enzyme, Cfr family  41.21 
 
 		 382 aa  231  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2993  radical SAM protein  39.5 
 
 		 356 aa  230  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00523882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.13 
 
 		 362 aa  230  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  38.89 
 
 		 350 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.67 
 
 		 362 aa  229  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4604  hypothetical protein  38.05 
 
 		 382 aa  229  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  39.89 
 
 		 342 aa  229  8e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06113  radical SAM enzyme, Cfr family  38.73 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245547  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1308  hypothetical protein  38.8 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.13 
 
 		 343 aa  229  1e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01053  radical SAM enzyme, Cfr family  38.73 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.184624  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6265  hypothetical protein  38.58 
 
 		 379 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>