More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_30965 on replicon NC_011695
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011695  PHATRDRAFT_30965  predicted protein  100 
 
 		 387 aa  813    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.747034  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_4583  predicted protein  46.56 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  39.55 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3745  radical SAM enzyme, Cfr family  43.64 
 
 		 329 aa  209  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  decreased coverage  0.00432991 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2783  radical SAM enzyme, Cfr family  41.74 
 
 		 408 aa  207  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  37.7 
 
 		 349 aa  197  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0928  radical SAM enzyme, Cfr family  40.8 
 
 		 364 aa  196  7e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.947592  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2180  radical SAM protein  43.51 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.29 
 
 		 343 aa  192  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0461  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.96 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.745055  normal  0.162604 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2191  radical SAM enzyme, Cfr family  39.8 
 
 		 392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.71 
 
 		 349 aa  190  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4305  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.13 
 
 		 363 aa  190  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.04 
 
 		 373 aa  189  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.563776  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  38.97 
 
 		 356 aa  189  9e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.34 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.38 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  39.1 
 
 		 371 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5022  radical SAM protein  38.24 
 
 		 397 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0427  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.64 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273579  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  37.33 
 
 		 369 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1429  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.57 
 
 		 373 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0876618 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1225  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.04 
 
 		 373 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.461537  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0458  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.06 
 
 		 368 aa  187  4e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3315  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.04 
 
 		 373 aa  187  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1043  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.46 
 
 		 341 aa  187  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1253  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.12 
 
 		 373 aa  187  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.405878  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1503  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.43 
 
 		 340 aa  186  4e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.578618  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3008  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.7 
 
 		 373 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00899057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1370  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.7 
 
 		 373 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3151  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.7 
 
 		 373 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00905599  hitchhiker  0.00812914 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  39.13 
 
 		 359 aa  186  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3129  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.02 
 
 		 380 aa  186  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3503  radical SAM protein  40.28 
 
 		 382 aa  186  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.46 
 
 		 395 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0799869 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1541  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.7 
 
 		 373 aa  186  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.865101  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1296  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.7 
 
 		 373 aa  185  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2317  radical SAM enzyme, Cfr family  38.73 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1422  radical SAM protein  37.62 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12366  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12087  predicted protein  40.79 
 
 		 340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0648  hypothetical protein  39.73 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.76 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1226  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.7 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2184  radical SAM enzyme, Cfr family  37.38 
 
 		 382 aa  185  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0620  hypothetical protein  40.34 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180215  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2232  radical SAM protein  38.22 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.750735  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  34.69 
 
 		 348 aa  184  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1711  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.42 
 
 		 347 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294696  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0591  hypothetical protein  39.49 
 
 		 372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.196855  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1292  radical SAM protein  36.45 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000206153  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1287  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.57 
 
 		 373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.36 
 
 		 373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106958  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2229  radical SAM enzyme, Cfr family  38.41 
 
 		 372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0679  hypothetical protein  39.04 
 
 		 409 aa  183  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1623  hypothetical protein  37.94 
 
 		 362 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271207 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  38.06 
 
 		 364 aa  182  6e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1581  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.72 
 
 		 343 aa  182  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000011547  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1198  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.24 
 
 		 365 aa  182  7e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.347563  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  38.67 
 
 		 382 aa  182  8.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.01 
 
 		 373 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0888845  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1631  hypothetical protein  38.41 
 
 		 372 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.212269  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1347  radical SAM protein  36.42 
 
 		 378 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2192  radical SAM protein  36.42 
 
 		 378 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2357  radical SAM protein  36.42 
 
 		 378 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  38.59 
 
 		 376 aa  182  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1109  radical SAM protein  36.42 
 
 		 378 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545154  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0426  radical SAM enzyme, Cfr family  36.59 
 
 		 359 aa  182  9.000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0060  radical SAM protein  36.42 
 
 		 378 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0447485  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2230  radical SAM protein  36.42 
 
 		 378 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1837  radical SAM protein  36.42 
 
 		 378 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.323888  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0665  radical SAM enzyme, Cfr family  37.5 
 
 		 341 aa  182  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  38.67 
 
 		 382 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2089  hypothetical protein  38.82 
 
 		 384 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1461  radical SAM protein  36.74 
 
 		 378 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0453987  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  37.25 
 
 		 377 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1087  radical SAM enzyme, Cfr family  36.98 
 
 		 383 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486861  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1167  radical SAM protein  36.98 
 
 		 374 aa  182  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5115  hypothetical protein  38.6 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1838  radical SAM protein  38.6 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662917 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2685  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.01 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000061721  normal  0.591184 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0372  radical SAM protein  39.16 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187269 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6265  hypothetical protein  38.6 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1869  radical SAM protein  39.27 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1814  radical SAM protein  38.6 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.72 
 
 		 372 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000522962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  38.08 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4255  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.17 
 
 		 386 aa  180  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1323  radical SAM enzyme, Cfr family  39.1 
 
 		 348 aa  179  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.46 
 
 		 362 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.4 
 
 		 365 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1245  hypothetical protein  37.63 
 
 		 382 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1113  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.33 
 
 		 373 aa  179  8e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.686108  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1905  radical SAM protein  38.97 
 
 		 403 aa  179  9e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1431  radical SAM enzyme, Cfr family  37.63 
 
 		 382 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0409  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.44 
 
 		 389 aa  179  9e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.112692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14830  hypothetical protein  39.22 
 
 		 379 aa  179  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2221  chloramphenicol/florfenicol resistance protein  37.23 
 
 		 344 aa  179  9e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  39.29 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.5 
 
 		 362 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2109  hypothetical protein  38.33 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.207444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>