More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2221 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2221  chloramphenicol/florfenicol resistance protein  100 
 
 		 344 aa  723    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  38.24 
 
 		 371 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  39.09 
 
 		 349 aa  231  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0286  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.37 
 
 		 361 aa  226  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3745  radical SAM enzyme, Cfr family  39.76 
 
 		 329 aa  226  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  decreased coverage  0.00432991 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2783  radical SAM enzyme, Cfr family  40.24 
 
 		 408 aa  225  8e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3583  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.92 
 
 		 399 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1043  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.71 
 
 		 341 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1313  radical SAM enzyme, Cfr family  36.2 
 
 		 360 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  37.32 
 
 		 354 aa  217  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1376  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.91 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1539  radical SAM protein  38.79 
 
 		 363 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.177286  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2624  radical SAM enzyme, Cfr family  36.87 
 
 		 342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10170  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.13 
 
 		 429 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0444  hypothetical protein  36.94 
 
 		 355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.44 
 
 		 342 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1503  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.31 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.578618  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  36 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4182  radical SAM protein  36.69 
 
 		 374 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  36.87 
 
 		 356 aa  209  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4305  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.69 
 
 		 363 aa  209  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1327  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.43 
 
 		 353 aa  209  8e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0426  radical SAM enzyme, Cfr family  38.28 
 
 		 359 aa  207  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0784  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.69 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1508  radical SAM enzyme, Cfr family  38.62 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.868502  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  35.63 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2203  radical SAM enzyme, Cfr family  36.02 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00426672  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0951  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.14 
 
 		 361 aa  206  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  37.54 
 
 		 344 aa  206  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.8 
 
 		 364 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1660  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.26 
 
 		 389 aa  206  6e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_3052  predicted protein  36.29 
 
 		 378 aa  204  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0409  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.38 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.112692  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2191  radical SAM enzyme, Cfr family  36.02 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  34.49 
 
 		 351 aa  204  3e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1172  radical SAM protein  34.39 
 
 		 343 aa  204  3e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0188  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.42 
 
 		 365 aa  203  3e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1711  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.73 
 
 		 347 aa  203  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294696  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2685  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.46 
 
 		 346 aa  202  5e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000061721  normal  0.591184 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.22 
 
 		 343 aa  202  6e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.43 
 
 		 347 aa  202  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1227  hypothetical protein  36.44 
 
 		 357 aa  202  8e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.75541  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.39 
 
 		 365 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0458  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.69 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1533  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.8 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0427  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.8 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273579  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.22 
 
 		 362 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.22 
 
 		 362 aa  200  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.22 
 
 		 362 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.22 
 
 		 362 aa  200  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.22 
 
 		 362 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  36.06 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.22 
 
 		 362 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.22 
 
 		 362 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.93 
 
 		 362 aa  200  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1581  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.28 
 
 		 343 aa  200  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000011547  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  35.77 
 
 		 382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0633  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.58 
 
 		 344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28470  radical SAM enzyme, Cfr family  35.87 
 
 		 344 aa  200  3.9999999999999996e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.267861  hitchhiker  0.00294853 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.22 
 
 		 362 aa  199  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1338  radical SAM enzyme, Cfr family  35.76 
 
 		 351 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0802459  normal  0.737261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5902  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.06 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.22 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2223  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.91 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522742  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  34.81 
 
 		 376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1166  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  33.9 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.800858  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.93 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1235  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.19 
 
 		 380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478405  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1323  radical SAM enzyme, Cfr family  32.46 
 
 		 348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3237  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.52 
 
 		 376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2379  hypothetical protein  34.91 
 
 		 365 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1590  radical SAM protein  37.34 
 
 		 318 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3687  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.63 
 
 		 362 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0083  radical SAM protein  36.5 
 
 		 391 aa  195  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09960  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.91 
 
 		 370 aa  195  8.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.434962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21300  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.39 
 
 		 465 aa  195  9e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.830404  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1388  radical SAM enzyme, Cfr family  36.9 
 
 		 462 aa  195  9e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126812  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3404  radical SAM enzyme, Cfr family  33.24 
 
 		 388 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00306025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1111  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.85 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2178  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.03 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0846545  hitchhiker  0.000495188 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1930  radical SAM enzyme, Cfr family  35.96 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3610  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.73 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1602  radical SAM enzyme, Cfr family  35.96 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.113295 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0825  hypothetical protein  35.41 
 
 		 366 aa  194  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.86 
 
 		 351 aa  193  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0167472  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  33.83 
 
 		 349 aa  193  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1678  radical SAM enzyme, Cfr family  33.14 
 
 		 371 aa  192  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  34.1 
 
 		 364 aa  192  8e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2558  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.8 
 
 		 351 aa  192  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.150479999999999e-35 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0683  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.02 
 
 		 365 aa  192  9e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.882739  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2871  radical SAM protein  34.38 
 
 		 393 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1623  hypothetical protein  36.04 
 
 		 362 aa  192  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4121  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.4 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0164  radical SAM enzyme, Cfr family  34.38 
 
 		 353 aa  191  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1631  hypothetical protein  35.55 
 
 		 372 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.212269  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1009  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  33.82 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.834278 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2317  radical SAM enzyme, Cfr family  34.97 
 
 		 372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0372  radical SAM protein  34.36 
 
 		 355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187269 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  33.63 
 
 		 364 aa  190  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.902149  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1277  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  33.63 
 
 		 364 aa  190  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>