More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1420 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1420  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  100 
 
 		 391 aa  788    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0340942  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11240  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  67 
 
 		 426 aa  537  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.43214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23560  radical SAM enzyme, Cfr family  71.63 
 
 		 364 aa  530  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1489  radical SAM enzyme, Cfr family  71.27 
 
 		 375 aa  529  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3404  radical SAM enzyme, Cfr family  70.11 
 
 		 388 aa  521  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1869  radical SAM protein  71.08 
 
 		 374 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2502  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  68.24 
 
 		 383 aa  520  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293735  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1009  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  68.14 
 
 		 376 aa  514  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.834278 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0683  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  69.13 
 
 		 365 aa  513  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.882739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  68.39 
 
 		 395 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0799869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1000  radical SAM enzyme, Cfr family  71.12 
 
 		 388 aa  509  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.189733  normal  0.570497 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3237  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  69.7 
 
 		 376 aa  500  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3677  radical SAM enzyme, Cfr family  68.68 
 
 		 365 aa  491  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21300  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  64.19 
 
 		 465 aa  485  1e-136  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.830404  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1185  radical SAM enzyme, Cfr family  66.23 
 
 		 389 aa  483  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1678  radical SAM enzyme, Cfr family  63.99 
 
 		 371 aa  467  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2114  radical SAM enzyme, Cfr family  64.82 
 
 		 368 aa  467  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10170  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  62.3 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09960  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  63.86 
 
 		 370 aa  454  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.434962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5902  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  62.53 
 
 		 368 aa  454  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2203  radical SAM enzyme, Cfr family  65.01 
 
 		 388 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00426672  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1327  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  65.24 
 
 		 353 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2223  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  63.76 
 
 		 365 aa  449  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522742  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1235  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  62.27 
 
 		 380 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478405  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3980  radical SAM enzyme, Cfr family  67.31 
 
 		 395 aa  442  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2178  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  63.36 
 
 		 372 aa  444  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0846545  hitchhiker  0.000495188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1987  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  64.69 
 
 		 374 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0876088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2006  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  64.69 
 
 		 374 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578114  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2052  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  64.69 
 
 		 374 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4121  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  62.3 
 
 		 365 aa  437  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12894  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  61.81 
 
 		 364 aa  431  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.942196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0409  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.58 
 
 		 389 aa  421  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.112692  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  59.04 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3577  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  60.59 
 
 		 421 aa  403  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1166  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  60.05 
 
 		 385 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.800858  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0286  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.58 
 
 		 361 aa  289  6e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4305  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.08 
 
 		 363 aa  272  6e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  46.84 
 
 		 354 aa  272  9e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3583  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.9 
 
 		 399 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1376  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.71 
 
 		 399 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  43.82 
 
 		 371 aa  263  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2783  radical SAM enzyme, Cfr family  46.49 
 
 		 408 aa  259  5.0000000000000005e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5022  radical SAM protein  43.6 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0164  radical SAM enzyme, Cfr family  46.67 
 
 		 353 aa  256  5e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.48 
 
 		 364 aa  255  7e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  40.91 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.18 
 
 		 365 aa  252  6e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.42 
 
 		 349 aa  248  9e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  42.3 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  40.96 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  39.46 
 
 		 348 aa  247  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1421  radical SAM protein  43.39 
 
 		 373 aa  246  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  41.37 
 
 		 342 aa  245  9e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1338  radical SAM enzyme, Cfr family  40.35 
 
 		 351 aa  243  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0802459  normal  0.737261 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  42.74 
 
 		 376 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2310  hypothetical protein  42.14 
 
 		 382 aa  242  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.55 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1999  hypothetical protein  43.32 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.175204 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1657  radical SAM enzyme, Cfr family  40.86 
 
 		 401 aa  239  6.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.33058  normal  0.466299 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.68 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.68 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.68 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.68 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.68 
 
 		 362 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.68 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.68 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.68 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.68 
 
 		 362 aa  237  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1167  radical SAM protein  44.05 
 
 		 374 aa  237  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1087  radical SAM enzyme, Cfr family  43.31 
 
 		 383 aa  236  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486861  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2184  radical SAM enzyme, Cfr family  42.11 
 
 		 382 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_3052  predicted protein  42.94 
 
 		 378 aa  236  5.0000000000000005e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2229  radical SAM enzyme, Cfr family  43.63 
 
 		 372 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  39.58 
 
 		 350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2317  radical SAM enzyme, Cfr family  43.06 
 
 		 372 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  43.44 
 
 		 377 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1631  hypothetical protein  43.06 
 
 		 372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.212269  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3687  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.1 
 
 		 362 aa  233  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1623  hypothetical protein  42.22 
 
 		 362 aa  233  6e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271207 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0633  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.39 
 
 		 344 aa  232  7.000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14830  hypothetical protein  42.01 
 
 		 379 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1590  radical SAM protein  43.57 
 
 		 318 aa  232  8.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  34.99 
 
 		 342 aa  232  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0620  hypothetical protein  41.14 
 
 		 370 aa  231  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180215  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  40.9 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2871  radical SAM protein  41.48 
 
 		 393 aa  230  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  40.71 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  41.32 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1313  radical SAM enzyme, Cfr family  42.6 
 
 		 360 aa  230  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1388  radical SAM enzyme, Cfr family  41.07 
 
 		 462 aa  230  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126812  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  41.03 
 
 		 366 aa  230  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38 
 
 		 343 aa  229  4e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0784  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.1 
 
 		 364 aa  229  5e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1308  hypothetical protein  42.01 
 
 		 378 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1711  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.02 
 
 		 347 aa  229  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294696  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.18 
 
 		 347 aa  229  6e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2310  radical SAM enzyme, Cfr family  40.49 
 
 		 349 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0772545  hitchhiker  0.000694436 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1869  radical SAM protein  41.67 
 
 		 382 aa  229  7e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  41.64 
 
 		 364 aa  229  8e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.43 
 
 		 343 aa  228  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>