More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1185 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1185  radical SAM enzyme, Cfr family  100 
 
 		 389 aa  794    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23560  radical SAM enzyme, Cfr family  78.33 
 
 		 364 aa  584  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1009  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  73.81 
 
 		 376 aa  566  1e-160  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.834278 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1489  radical SAM enzyme, Cfr family  71.24 
 
 		 375 aa  541  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2502  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  68.87 
 
 		 383 aa  507  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293735  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21300  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  62.66 
 
 		 465 aa  492  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.830404  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1420  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  66.23 
 
 		 391 aa  493  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0340942  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10170  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  64.38 
 
 		 429 aa  476  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11240  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  58.78 
 
 		 426 aa  465  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.43214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3237  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  64.44 
 
 		 376 aa  465  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  62.26 
 
 		 395 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0799869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3404  radical SAM enzyme, Cfr family  62.99 
 
 		 388 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1869  radical SAM protein  63.99 
 
 		 374 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2114  radical SAM enzyme, Cfr family  62.78 
 
 		 368 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1000  radical SAM enzyme, Cfr family  63.41 
 
 		 388 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.189733  normal  0.570497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4121  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  61.56 
 
 		 365 aa  430  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1678  radical SAM enzyme, Cfr family  59 
 
 		 371 aa  429  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2223  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  62.4 
 
 		 365 aa  431  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522742  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5902  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  59.61 
 
 		 368 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0683  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  60.72 
 
 		 365 aa  426  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.882739  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0409  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  59.66 
 
 		 389 aa  427  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.112692  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3677  radical SAM enzyme, Cfr family  60.66 
 
 		 365 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09960  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  59.34 
 
 		 370 aa  423  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.434962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1235  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  59.95 
 
 		 380 aa  413  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478405  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3980  radical SAM enzyme, Cfr family  62.71 
 
 		 395 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2178  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  60.72 
 
 		 372 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0846545  hitchhiker  0.000495188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1327  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  60.51 
 
 		 353 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12894  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  59.32 
 
 		 364 aa  403  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.942196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1987  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  62.57 
 
 		 374 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0876088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2203  radical SAM enzyme, Cfr family  57.53 
 
 		 388 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00426672  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2006  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  62.57 
 
 		 374 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578114  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2052  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  62.57 
 
 		 374 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  53.95 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3577  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  58.04 
 
 		 421 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1166  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.22 
 
 		 385 aa  350  3e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.800858  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0286  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.79 
 
 		 361 aa  269  5e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4305  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.54 
 
 		 363 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0164  radical SAM enzyme, Cfr family  45.35 
 
 		 353 aa  253  3e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  45.81 
 
 		 354 aa  250  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2783  radical SAM enzyme, Cfr family  41.69 
 
 		 408 aa  249  7e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1376  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.36 
 
 		 399 aa  249  8e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  42.14 
 
 		 342 aa  245  8e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3583  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.78 
 
 		 399 aa  242  7e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1338  radical SAM enzyme, Cfr family  39.04 
 
 		 351 aa  239  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0802459  normal  0.737261 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.29 
 
 		 349 aa  237  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  39.88 
 
 		 344 aa  236  6e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  40.64 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  40.27 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_3052  predicted protein  40.49 
 
 		 378 aa  231  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.35 
 
 		 365 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  39.18 
 
 		 356 aa  230  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0633  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.87 
 
 		 344 aa  229  5e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1533  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.33 
 
 		 349 aa  229  6e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  37.25 
 
 		 349 aa  228  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.22 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.66 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  38.92 
 
 		 342 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0665  radical SAM enzyme, Cfr family  37.99 
 
 		 341 aa  223  4e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.21 
 
 		 347 aa  223  6e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1699  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.52 
 
 		 348 aa  222  7e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1711  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.63 
 
 		 347 aa  222  8e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.22 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5022  radical SAM protein  39.19 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0834  radical SAM protein  39.43 
 
 		 428 aa  217  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281827 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28470  radical SAM enzyme, Cfr family  36.96 
 
 		 344 aa  216  4e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.267861  hitchhiker  0.00294853 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  36.95 
 
 		 350 aa  215  9e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.08 
 
 		 342 aa  215  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  36.56 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  39.06 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2740  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.52 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1115  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.24 
 
 		 392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1183  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.41 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0421  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.41 
 
 		 398 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.662236  hitchhiker  0.00298691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1290  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.41 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1999  hypothetical protein  39.31 
 
 		 394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.175204 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1323  radical SAM enzyme, Cfr family  37.96 
 
 		 348 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3745  radical SAM enzyme, Cfr family  40.61 
 
 		 329 aa  213  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  decreased coverage  0.00432991 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  38.74 
 
 		 382 aa  212  7e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1503  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.11 
 
 		 340 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.578618  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1336  radical SAM family enzyme  36.54 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  38.74 
 
 		 382 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1397  radical SAM protein  36.54 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.724249  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1043  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.92 
 
 		 341 aa  211  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  39.71 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6265  hypothetical protein  38.79 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1838  radical SAM protein  38.79 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662917 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1814  radical SAM protein  38.79 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.9 
 
 		 388 aa  211  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02409  predicted enzyme  36.41 
 
 		 384 aa  210  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1151  radical SAM enzyme, Cfr family  36.41 
 
 		 384 aa  210  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.390398  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02371  hypothetical protein  36.41 
 
 		 384 aa  210  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.31 
 
 		 362 aa  210  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2669  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.41 
 
 		 384 aa  210  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253648 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1160  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.41 
 
 		 384 aa  210  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0206768 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2892  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.41 
 
 		 384 aa  210  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2801  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.41 
 
 		 384 aa  210  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  38.3 
 
 		 359 aa  210  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2357  radical SAM protein  37.99 
 
 		 378 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0060  radical SAM protein  37.99 
 
 		 378 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0447485  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2192  radical SAM protein  37.99 
 
 		 378 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>