185 genes were found for organism Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Slin_6642  CDS  NC_013731  83  2350  -  2268  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_003391398  normal  1  normal  0.622167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6643  CDS  NC_013731  2903  3487  +  585  transcriptional regulator, AraC family  YP_003391399  normal  1  normal  0.367926  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6644  CDS  NC_013731  3623  5884  +  2262  copper-translocating P-type ATPase  YP_003391400  normal  0.935468  normal  0.257295  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6645  CDS  NC_013731  5936  6157  +  222  hypothetical protein  YP_003391401  normal  0.352702  normal  0.381791  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6646  CDS  NC_013731  6257  6769  +  513  protein of unknown function DUF305  YP_003391402  normal  0.350625  normal  0.51653  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6647  CDS  NC_013731  6864  9704  +  2841  multicopper oxidase type 3  YP_003391403  normal  0.0481943  normal  0.204114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6648  CDS  NC_013731  9819  10154  -  336  hypothetical protein  YP_003391404  normal  0.136312  normal  0.239967  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6649  CDS  NC_013731  10347  10766  -  420  hypothetical protein  YP_003391405  normal  0.164542  normal  0.314195  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6650  CDS  NC_013731  10817  11617  -  801  hypothetical protein  YP_003391406  normal  0.237631  normal  0.336128  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6651  CDS  NC_013731  11605  12366  -  762  hypothetical protein  YP_003391407  normal  0.240923  normal  0.142646  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6652  CDS  NC_013731  12372  14438  -  2067  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  YP_003391408  normal  0.640624  normal  0.369043  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6653  CDS  NC_013731  14474  15007  -  534  hypothetical protein  YP_003391409  normal  1  normal  0.374576  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6654  CDS  NC_013731  15111  15875  -  765  hypothetical protein  YP_003391410  normal  1  normal  0.494147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6655  CDS  NC_013731  16468  16695  +  228  hypothetical protein  YP_003391411  normal  1  normal  0.725856  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6656  CDS  NC_013731  16788  17381  -  594  protein of unknown function DUF305  YP_003391412  normal  1  normal  0.817107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6657  CDS  NC_013731  17407  18036  -  630  protein of unknown function DUF305  YP_003391413  normal  1  normal  0.50824  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6658  CDS  NC_013731  18230  19480  +  1251  hypothetical protein  YP_003391414  normal  0.613149  normal  0.601016  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6659  CDS  NC_013731  19914  20759  -  846  hypothetical protein  YP_003391415  normal  0.78613  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6660  CDS  NC_013731  21111  21233  +  123  hypothetical protein  YP_003391416  normal  0.357462  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6661  CDS  NC_013731  21488  22459  +  972  initiator RepB protein  YP_003391417  normal  0.486631  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6662  CDS  NC_013731  22487  22978  +  492  hypothetical protein  YP_003391418  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6663  CDS  NC_013731  23535  23711  +  177  hypothetical protein  YP_003391419  normal  0.651491  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6664  CDS  NC_013731  23716  23868  -  153  hypothetical protein  YP_003391420  normal  0.472083  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6665  CDS  NC_013731  24091  25305  +  1215  integrase family protein  YP_003391421  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6666  CDS  NC_013731  25406  25615  -  210  hypothetical protein  YP_003391422  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6667  CDS  NC_013731  25870  26940  +  1071  hypothetical protein  YP_003391423  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6668  CDS  NC_013731  27007  28416  +  1410  histidine kinase internal region  YP_003391424  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6669  CDS  NC_013731  28416  29144  +  729  two component transcriptional regulator, LytTR family  YP_003391425  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6670  CDS  NC_013731  29411  29740  -  330  hypothetical protein  YP_003391426  normal  0.994203  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6671  CDS  NC_013731  29869  31305  +  1437  hypothetical protein  YP_003391427  normal  0.686433  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6672  CDS  NC_013731  31286  31624  +  339  hypothetical protein  YP_003391428  normal  0.0915339  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6673  CDS  NC_013731  31642  32250  +  609  hypothetical protein  YP_003391429  hitchhiker  0.00901736  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6674    NC_013731  32535  32765  +  231      hitchhiker  0.00383141  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6675  CDS  NC_013731  32852  34090  +  1239  hypothetical protein  YP_003391430  hitchhiker  0.00251998  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6676  CDS  NC_013731  34303  35085  -  783  HNH endonuclease  YP_003391431  hitchhiker  0.000780736  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6677  CDS  NC_013731  35082  35750  -  669  hypothetical protein  YP_003391432  hitchhiker  0.00000431405  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6678  CDS  NC_013731  35753  37171  -  1419  hypothetical protein  YP_003391433  hitchhiker  0.0000129285  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6679  CDS  NC_013731  37201  39846  -  2646  hypothetical protein  YP_003391434  decreased coverage  0.00000129559  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6680  CDS  NC_013731  39855  41789  -  1935  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  YP_003391435  decreased coverage  0.000000759129  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6681  CDS  NC_013731  41839  42429  -  591  hypothetical protein  YP_003391436  hitchhiker  0.0000157762  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6682  CDS  NC_013731  42443  43420  -  978  hypothetical protein  YP_003391437  hitchhiker  0.000160222  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6683  CDS  NC_013731  43455  46355  -  2901  UvrD/REP helicase  YP_003391438  normal  0.0759039  normal  0.87543  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6684  CDS  NC_013731  46631  47029  -  399  PilT protein domain protein  YP_003391439  normal  0.185489  normal  0.593771  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6685  CDS  NC_013731  47029  47244  -  216  hypothetical protein  YP_003391440  normal  0.213456  normal  0.442986  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6686  CDS  NC_013731  47616  49427  -  1812  hypothetical protein  YP_003391441  normal  0.602839  normal  0.700574  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6687  CDS  NC_013731  50162  50461  -  300  hypothetical protein  YP_003391442  normal  0.321408  normal  0.385698  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6688  CDS  NC_013731  50470  51393  -  924  hypothetical protein  YP_003391443  normal  0.345618  normal  0.278313  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6689  CDS  NC_013731  51437  51625  -  189  hypothetical protein  YP_003391444  normal  0.292073  normal  0.295016  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6690  CDS  NC_013731  51671  52036  -  366  hypothetical protein  YP_003391445  normal  0.168232  normal  0.304353  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6691  CDS  NC_013731  52144  52557  -  414  hypothetical protein  YP_003391446  normal  0.85497  normal  0.233911  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6692  CDS  NC_013731  52613  53002  -  390  hypothetical protein  YP_003391447  normal  1  normal  0.16259  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6693  CDS  NC_013731  53091  53804  -  714  hypothetical protein  YP_003391448  normal  1  normal  0.129091  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6694  CDS  NC_013731  53905  54108  -  204  hypothetical protein  YP_003391449  normal  0.890822  normal  0.202876  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6695  CDS  NC_013731  54166  55533  -  1368  hypothetical protein  YP_003391450  normal  0.681272  normal  0.16594  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6696  CDS  NC_013731  55627  57042  -  1416  hypothetical protein  YP_003391451  normal  1  normal  0.116311  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6697  CDS  NC_013731  57060  59060  -  2001  hypothetical protein  YP_003391452  normal  0.937455  normal  0.0945721  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6698  CDS  NC_013731  59150  59965  +  816  Peptidase M23  YP_003391453  normal  1  normal  0.145065  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6699  CDS  NC_013731  59976  60386  -  411  transcriptional regulator, XRE family  YP_003391454  normal  1  normal  0.181596  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6700  CDS  NC_013731  60379  62436  -  2058  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  YP_003391455  normal  1  normal  0.170783  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6701  CDS  NC_013731  62591  63913  -  1323  Relaxase/mobilization nuclease family protein  YP_003391456  normal  1  normal  0.201149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6702  CDS  NC_013731  63895  64209  -  315  hypothetical protein  YP_003391457  normal  0.763021  normal  0.291701  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6703  CDS  NC_013731  65063  65773  +  711  ATPase-like protein involved in chromosome partitioning  YP_003391458  normal  1  normal  0.183596  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6704  CDS  NC_013731  65777  66328  +  552  hypothetical protein  YP_003391459  normal  1  normal  0.123398  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6705  CDS  NC_013731  66325  67002  +  678  hypothetical protein  YP_003391460  normal  0.873514  normal  0.122686  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6706  CDS  NC_013731  67068  67364  +  297  hypothetical protein  YP_003391461  normal  0.228395  normal  0.28265  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6707  CDS  NC_013731  67384  67719  +  336  hypothetical protein  YP_003391462  normal  0.353837  normal  0.283717  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6708  CDS  NC_013731  67721  68047  +  327  hypothetical protein  YP_003391463  normal  0.363834  normal  0.277012  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6709  CDS  NC_013731  68031  70568  +  2538  hypothetical protein  YP_003391464  normal  0.534859  normal  0.161214  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6710  CDS  NC_013731  70649  71470  +  822  hypothetical protein  YP_003391465  normal  0.688835  normal  0.245956  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6711  CDS  NC_013731  71467  72351  +  885  hypothetical protein  YP_003391466  normal  0.112808  normal  0.194949  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6712  CDS  NC_013731  72363  73415  +  1053  hypothetical protein  YP_003391467  normal  0.0171305  normal  0.204642  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6713  CDS  NC_013731  73417  74067  +  651  hypothetical protein  YP_003391468  hitchhiker  0.00339987  normal  0.188379  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6714  CDS  NC_013731  74320  75642  +  1323  hypothetical protein  YP_003391469  hitchhiker  0.0000258081  normal  0.407445  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6715  CDS  NC_013731  75669  76787  +  1119  hypothetical protein  YP_003391470  hitchhiker  0.0000000687722  normal  0.490273  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6716  CDS  NC_013731  76852  76992  -  141  hypothetical protein  YP_003391471  unclonable  0.00000000000593591  normal  0.465298  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6717  CDS  NC_013731  77259  78218  -  960  domain of unknown function DUF1738  YP_003391472  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6718  CDS  NC_013731  78583  78996  -  414  hypothetical protein  YP_003391473  hitchhiker  0.000322245  normal  0.600532  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6719  CDS  NC_013731  79056  79352  -  297  hypothetical protein  YP_003391474  hitchhiker  0.00740165  normal  0.586004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6720  CDS  NC_013731  79364  79744  -  381  hypothetical protein  YP_003391475  normal  0.053461  normal  0.600532  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6721  CDS  NC_013731  79741  80019  -  279  hypothetical protein  YP_003391476  normal  0.123687  normal  0.770083  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6722  CDS  NC_013731  80368  85392  -  5025  Methyltransferase type 11  YP_003391477  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6723  CDS  NC_013731  85397  85681  -  285  hypothetical protein  YP_003391478  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6724  CDS  NC_013731  86652  86873  +  222  hypothetical protein  YP_003391479  normal  1  normal  0.988787  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6725  CDS  NC_013731  86909  87151  +  243  hypothetical protein  YP_003391480  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6726  CDS  NC_013731  87148  87561  +  414  hypothetical protein  YP_003391481  normal  1  normal  0.818296  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6727  CDS  NC_013731  87878  88966  -  1089  glutamine cyclotransferase  YP_003391482  normal  1  normal  0.740303  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6728  CDS  NC_013731  89297  89689  +  393  Endoribonuclease L-PSP  YP_003391483  normal  1  normal  0.371107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6729  CDS  NC_013731  89809  90783  +  975  Helix-turn-helix type 11 domain protein  YP_003391484  normal  1  normal  0.41486  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6730  CDS  NC_013731  91244  93445  +  2202  TonB-dependent receptor  YP_003391485  normal  1  normal  0.23656  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6731  CDS  NC_013731  93535  94569  -  1035  protein of unknown function DUF81  YP_003391486  normal  1  normal  0.379073  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6732  CDS  NC_013731  94594  95349  -  756  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  YP_003391487  normal  1  normal  0.322739  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6733  CDS  NC_013731  95659  96072  -  414  protein of unknown function DUF6 transmembrane  YP_003391488  normal  1  normal  0.613409  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6734  CDS  NC_013731  96250  97266  -  1017  hypothetical protein  YP_003391489  normal  1  normal  0.745861  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6735  CDS  NC_013731  97283  98020  -  738  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  YP_003391490  normal  1  normal  0.418259  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6736  CDS  NC_013731  98234  98914  +  681  two component transcriptional regulator, winged helix family  YP_003391491  normal  0.973659  normal  0.523736  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6737  CDS  NC_013731  98911  100176  +  1266  histidine kinase  YP_003391492  normal  0.978688  normal  0.372172  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6738  CDS  NC_013731  100262  100720  +  459  hypothetical protein  YP_003391493  normal  1  normal  0.396339  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6739  CDS  NC_013731  100949  103447  +  2499  TonB-dependent receptor  YP_003391494  normal  0.616271  normal  0.465298  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6740  CDS  NC_013731  103752  104339  -  588  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  YP_003391495  normal  1  normal  0.515354  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6741  CDS  NC_013731  104446  104655  -  210  hypothetical protein  YP_003391496  normal  1  normal  0.612072  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>