47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6740 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013731  Slin_6740  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  100 
 
 
195 aa  391  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.515354 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0213  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  37.3 
 
 
264 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53187  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3035  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  57.76 
 
 
264 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1244  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  58.33 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761762  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2795  3''-kinase  58.33 
 
 
265 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.342668 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4830  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  51.11 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.975456 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5439  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  51.11 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5423  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  51.11 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4780  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  48.12 
 
 
288 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.35446  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3891  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  51.97 
 
 
271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.571465 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5323  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  47.37 
 
 
286 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3331  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  55.86 
 
 
300 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0145653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0248  putative streptomycin phosphotransferase  53.45 
 
 
120 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7130  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  50.78 
 
 
267 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3719  streptomycin 3''-kinase  55.21 
 
 
266 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2227  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  48.25 
 
 
284 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000351208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3432  streptomycin 3''-kinase  49.61 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2987  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  52.21 
 
 
266 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0510787 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40450  streptomycin 3''-phosphotransferase  45.75 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2726  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  52.21 
 
 
266 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.167772  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2457  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  54.84 
 
 
271 aa  115  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35670  streptomycin 6-kinase  59.34 
 
 
293 aa  111  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1923  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  45.54 
 
 
270 aa  98.6  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.970789  normal  0.364097 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2501  3''-kinase  45.87 
 
 
277 aa  84.7  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009789  EcE24377A_B0003  streptomycin resistance protein, StrB  46.51 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2670  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  46.51 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.02986  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5338  streptomycin phosphotransferase  46.51 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0045  streptomycin resistance protein StrB  46.51 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0129  aminoglycoside resistance protein B  46.51 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.974008  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1571  aminoglycoside resistance protein B  46.51 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.078076  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0084  streptomycin phosphotransferase B  45.68 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.707576 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1673  streptomycin resistance protein  41.35 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0514  aminoglycoside phosphotransferase family protein  34.86 
 
 
323 aa  68.2  0.00000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3440  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  43.48 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.0646314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1604  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  42.71 
 
 
310 aa  65.5  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0859815  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1665  hydroxyurea phosphotransferase  34.86 
 
 
468 aa  65.1  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2188  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  32.41 
 
 
300 aa  62.8  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4087  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  32.61 
 
 
311 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1892  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  32.17 
 
 
303 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.565098  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3746  kinase  35.44 
 
 
295 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2429  streptomycin 6-kinase  31.87 
 
 
306 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0298  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  30.86 
 
 
309 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.449073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0803  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  39.74 
 
 
285 aa  45.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4253  6-kinase  28.07 
 
 
309 aa  44.7  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2285  aminoglycoside phosphotransferase  32.46 
 
 
329 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5378  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  29.03 
 
 
307 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2219  6-kinase  34.52 
 
 
307 aa  41.6  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000195606  decreased coverage  0.000000830578 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>