27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6658 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013732  Slin_6905  hypothetical protein  87.62 
 
 		 418 aa  773    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10031  normal  0.668757 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6658  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  868    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613149  normal  0.601016 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3075  hypothetical protein  58.68 
 
 		 414 aa  513  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4140  hypothetical protein  55.15 
 
 		 411 aa  489  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.813287  normal  0.597426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4209  hypothetical protein  54.15 
 
 		 424 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6120  type II site-specific deoxyribonuclease (type II restriction enzyme) involved in resistance to copper (Cu(I)/Cu(II))  46.7 
 
 		 421 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.397571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2432  hypothetical protein  45.73 
 
 		 425 aa  368  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2541  hypothetical protein  44.36 
 
 		 430 aa  360  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0181708  normal  0.226498 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2679  hypothetical protein  43.94 
 
 		 420 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.794848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4599  hypothetical protein  43.36 
 
 		 438 aa  356  5e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79809  normal  0.613428 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4564  hypothetical protein  43.26 
 
 		 420 aa  355  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4827  hypothetical protein  43.99 
 
 		 438 aa  353  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.202847  normal  0.0862783 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1835  hypothetical protein  45.65 
 
 		 440 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.217821  hitchhiker  0.00106364 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5105  hypothetical protein  45.65 
 
 		 421 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753919 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0135  hypothetical protein  44.82 
 
 		 430 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1724  hypothetical protein  43.97 
 
 		 421 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304081  normal  0.948453 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1486  hypothetical protein  44.91 
 
 		 420 aa  348  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5341  hypothetical protein  43.97 
 
 		 421 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3271  hypothetical protein  42.41 
 
 		 419 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.146801  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1009  hypothetical protein  42.31 
 
 		 430 aa  347  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.780626  normal  0.165518 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2577  hypothetical protein  45.03 
 
 		 383 aa  346  4e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2312  hypothetical protein  45 
 
 		 426 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.951883 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0742  hypothetical protein  39.41 
 
 		 407 aa  301  2e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.138801  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2715  hypothetical protein  38.36 
 
 		 478 aa  111  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000041163  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1708  hypothetical protein  31.49 
 
 		 348 aa  103  7e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3239  hypothetical protein  31.35 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0081017  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0726  Type II site-specific deoxyribonuclease  25.29 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000123282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>