30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6120 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6120  type II site-specific deoxyribonuclease (type II restriction enzyme) involved in resistance to copper (Cu(I)/Cu(II))  100 
 
 		 421 aa  867    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.397571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5341  hypothetical protein  78.15 
 
 		 421 aa  691    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5105  hypothetical protein  77.2 
 
 		 421 aa  685    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1835  hypothetical protein  74.35 
 
 		 440 aa  665    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.217821  hitchhiker  0.00106364 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1724  hypothetical protein  78.15 
 
 		 421 aa  691    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304081  normal  0.948453 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2679  hypothetical protein  65.32 
 
 		 420 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.794848 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4564  hypothetical protein  64.37 
 
 		 420 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1486  hypothetical protein  63.74 
 
 		 420 aa  549  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2432  hypothetical protein  63.42 
 
 		 425 aa  545  1e-154  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2541  hypothetical protein  64.73 
 
 		 430 aa  545  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0181708  normal  0.226498 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4827  hypothetical protein  62.71 
 
 		 438 aa  535  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.202847  normal  0.0862783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1009  hypothetical protein  64.75 
 
 		 430 aa  534  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.780626  normal  0.165518 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0135  hypothetical protein  62.17 
 
 		 430 aa  529  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4599  hypothetical protein  61.69 
 
 		 438 aa  525  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79809  normal  0.613428 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2312  hypothetical protein  60.57 
 
 		 426 aa  518  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.951883 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3271  hypothetical protein  60.48 
 
 		 419 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.146801  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2577  hypothetical protein  63.93 
 
 		 383 aa  488  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6905  hypothetical protein  49.41 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10031  normal  0.668757 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4209  hypothetical protein  46.56 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6658  hypothetical protein  46.1 
 
 		 416 aa  365  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613149  normal  0.601016 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4140  hypothetical protein  43.65 
 
 		 411 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.813287  normal  0.597426 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3075  hypothetical protein  41.01 
 
 		 414 aa  324  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0742  hypothetical protein  40.74 
 
 		 407 aa  303  5.000000000000001e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.138801  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2715  hypothetical protein  39.41 
 
 		 478 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000041163  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1708  hypothetical protein  33.76 
 
 		 348 aa  94  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3239  hypothetical protein  31.13 
 
 		 363 aa  69.7  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0081017  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0726  Type II site-specific deoxyribonuclease  28.24 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000123282  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0100  hypothetical protein  22.78 
 
 		 243 aa  57  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  unclonable  6.44267e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0635  hypothetical protein  21.19 
 
 		 242 aa  52.8  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0669  hypothetical protein  22.22 
 
 		 242 aa  43.9  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>