29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3239 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3239  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  753    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0081017  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2715  hypothetical protein  38.5 
 
 		 478 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000041163  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1708  hypothetical protein  25.5 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2577  hypothetical protein  40.44 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4564  hypothetical protein  35.26 
 
 		 420 aa  82.8  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1486  hypothetical protein  39.85 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0135  hypothetical protein  31.2 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2679  hypothetical protein  34.09 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.794848 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2432  hypothetical protein  31.36 
 
 		 425 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4209  hypothetical protein  34.68 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3271  hypothetical protein  35.92 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.146801  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5341  hypothetical protein  36.3 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1009  hypothetical protein  34.09 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.780626  normal  0.165518 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1724  hypothetical protein  36.3 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304081  normal  0.948453 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1835  hypothetical protein  35.82 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.217821  hitchhiker  0.00106364 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5105  hypothetical protein  35.82 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753919 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4827  hypothetical protein  37.12 
 
 		 438 aa  69.7  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.202847  normal  0.0862783 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6120  type II site-specific deoxyribonuclease (type II restriction enzyme) involved in resistance to copper (Cu(I)/Cu(II))  31.13 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.397571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0742  hypothetical protein  30.29 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.138801  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4140  hypothetical protein  31.54 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.813287  normal  0.597426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2541  hypothetical protein  33.33 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0181708  normal  0.226498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4599  hypothetical protein  36.84 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79809  normal  0.613428 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3075  hypothetical protein  37.3 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2312  hypothetical protein  36.22 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.951883 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6658  hypothetical protein  31.35 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613149  normal  0.601016 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6905  hypothetical protein  34.71 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10031  normal  0.668757 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1889  protein of unknown function DUF55  26.71 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000171579  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0726  Type II site-specific deoxyribonuclease  26.26 
 
 		 358 aa  53.1  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000123282  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1832  protein of unknown function DUF55  19.74 
 
 		 156 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>