27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3075 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3075  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  846    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4140  hypothetical protein  62.93 
 
 
411 aa  543  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.813287  normal  0.597426 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6905  hypothetical protein  59.07 
 
 
418 aa  524  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10031  normal  0.668757 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6658  hypothetical protein  58.68 
 
 
416 aa  510  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613149  normal  0.601016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4209  hypothetical protein  49.76 
 
 
424 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2541  hypothetical protein  41.26 
 
 
430 aa  358  8e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0181708  normal  0.226498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4599  hypothetical protein  39.71 
 
 
438 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79809  normal  0.613428 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4827  hypothetical protein  40.19 
 
 
438 aa  356  5e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.202847  normal  0.0862783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1009  hypothetical protein  40.09 
 
 
430 aa  351  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.780626  normal  0.165518 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1486  hypothetical protein  41.56 
 
 
420 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69852  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2432  hypothetical protein  41.67 
 
 
425 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323956  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6120  type II site-specific deoxyribonuclease (type II restriction enzyme) involved in resistance to copper (Cu(I)/Cu(II))  42.21 
 
 
421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.397571  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0135  hypothetical protein  42.28 
 
 
430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4564  hypothetical protein  41.33 
 
 
420 aa  337  2.9999999999999997e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2679  hypothetical protein  41.89 
 
 
420 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.794848 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3271  hypothetical protein  40.14 
 
 
419 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.146801  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2312  hypothetical protein  41.5 
 
 
426 aa  327  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.951883 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5105  hypothetical protein  40.24 
 
 
421 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1835  hypothetical protein  40.14 
 
 
440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.217821  hitchhiker  0.00106364 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1724  hypothetical protein  40.14 
 
 
421 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304081  normal  0.948453 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5341  hypothetical protein  40.14 
 
 
421 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2577  hypothetical protein  39.32 
 
 
383 aa  309  5e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0742  hypothetical protein  41.28 
 
 
407 aa  306  5.0000000000000004e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.138801  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2715  hypothetical protein  40.38 
 
 
478 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000041163  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1708  hypothetical protein  29.07 
 
 
348 aa  84.7  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3239  hypothetical protein  37.3 
 
 
363 aa  66.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0081017  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0726  Type II site-specific deoxyribonuclease  24.88 
 
 
358 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000123282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>