30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5105 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6120  type II site-specific deoxyribonuclease (type II restriction enzyme) involved in resistance to copper (Cu(I)/Cu(II))  77.2 
 
 		 421 aa  685    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.397571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5341  hypothetical protein  93.11 
 
 		 421 aa  817    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5105  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  864    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1835  hypothetical protein  91.45 
 
 		 440 aa  802    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.217821  hitchhiker  0.00106364 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1724  hypothetical protein  93.11 
 
 		 421 aa  817    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304081  normal  0.948453 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2679  hypothetical protein  64.85 
 
 		 420 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.794848 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4564  hypothetical protein  63.66 
 
 		 420 aa  560  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1486  hypothetical protein  65.4 
 
 		 420 aa  560  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2432  hypothetical protein  63.9 
 
 		 425 aa  551  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3271  hypothetical protein  64.75 
 
 		 419 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.146801  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2541  hypothetical protein  64.49 
 
 		 430 aa  542  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0181708  normal  0.226498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4599  hypothetical protein  62.41 
 
 		 438 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79809  normal  0.613428 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4827  hypothetical protein  62.23 
 
 		 438 aa  530  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.202847  normal  0.0862783 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0135  hypothetical protein  60.96 
 
 		 430 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1009  hypothetical protein  62.59 
 
 		 430 aa  520  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.780626  normal  0.165518 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2312  hypothetical protein  59.38 
 
 		 426 aa  510  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.951883 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2577  hypothetical protein  65.78 
 
 		 383 aa  503  1e-141  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6905  hypothetical protein  47.26 
 
 		 418 aa  358  8e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10031  normal  0.668757 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4209  hypothetical protein  46.26 
 
 		 424 aa  352  5e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6658  hypothetical protein  44.81 
 
 		 416 aa  346  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613149  normal  0.601016 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4140  hypothetical protein  42.75 
 
 		 411 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.813287  normal  0.597426 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3075  hypothetical protein  40.52 
 
 		 414 aa  316  6e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0742  hypothetical protein  41.98 
 
 		 407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.138801  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2715  hypothetical protein  34.52 
 
 		 478 aa  96.7  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000041163  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1708  hypothetical protein  30 
 
 		 348 aa  88.6  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3239  hypothetical protein  35.82 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0081017  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0726  Type II site-specific deoxyribonuclease  26.32 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000123282  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0100  hypothetical protein  25.47 
 
 		 243 aa  54.3  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  unclonable  6.44267e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0635  hypothetical protein  20 
 
 		 242 aa  51.6  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0669  hypothetical protein  17.93 
 
 		 242 aa  46.2  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>