21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0635 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0635  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  494  1e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0100  hypothetical protein  55.16 
 
 
243 aa  256  2e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  unclonable  6.44267e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0669  hypothetical protein  49.78 
 
 
242 aa  220  9.999999999999999e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0742  hypothetical protein  44.53 
 
 
129 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.228356  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0742  hypothetical protein  30 
 
 
407 aa  59.7  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.138801  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1835  hypothetical protein  22.76 
 
 
440 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.217821  hitchhiker  0.00106364 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5341  hypothetical protein  19.87 
 
 
421 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1724  hypothetical protein  19.87 
 
 
421 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304081  normal  0.948453 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6120  type II site-specific deoxyribonuclease (type II restriction enzyme) involved in resistance to copper (Cu(I)/Cu(II))  21.19 
 
 
421 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.397571  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3271  hypothetical protein  20.26 
 
 
419 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.146801  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0135  hypothetical protein  20 
 
 
430 aa  52.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2577  hypothetical protein  18.71 
 
 
383 aa  52  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5105  hypothetical protein  20 
 
 
421 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4209  hypothetical protein  24.07 
 
 
424 aa  48.9  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2679  hypothetical protein  24.26 
 
 
420 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.794848 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1009  hypothetical protein  20.39 
 
 
430 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.780626  normal  0.165518 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1486  hypothetical protein  19.18 
 
 
420 aa  47  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69852  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2715  hypothetical protein  22.29 
 
 
478 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000041163  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2312  hypothetical protein  18.72 
 
 
426 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.951883 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2541  hypothetical protein  19.7 
 
 
430 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0181708  normal  0.226498 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4564  hypothetical protein  19.35 
 
 
420 aa  43.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>