21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0100 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0100  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  504  9.999999999999999e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  unclonable  6.44267e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0669  hypothetical protein  56.12 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0635  hypothetical protein  55.16 
 
 		 242 aa  256  2e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0742  hypothetical protein  55.56 
 
 		 129 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.228356  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0742  hypothetical protein  33.82 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.138801  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3271  hypothetical protein  26.8 
 
 		 419 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.146801  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1486  hypothetical protein  26.76 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2577  hypothetical protein  24.68 
 
 		 383 aa  57  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6120  type II site-specific deoxyribonuclease (type II restriction enzyme) involved in resistance to copper (Cu(I)/Cu(II))  22.78 
 
 		 421 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.397571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2715  hypothetical protein  26.39 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000041163  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1724  hypothetical protein  25.47 
 
 		 421 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304081  normal  0.948453 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5341  hypothetical protein  25.47 
 
 		 421 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1835  hypothetical protein  22.78 
 
 		 440 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.217821  hitchhiker  0.00106364 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5105  hypothetical protein  25.47 
 
 		 421 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753919 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0135  hypothetical protein  24.82 
 
 		 430 aa  53.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4564  hypothetical protein  24.82 
 
 		 420 aa  52.4  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2541  hypothetical protein  25.9 
 
 		 430 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0181708  normal  0.226498 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1009  hypothetical protein  23.19 
 
 		 430 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.780626  normal  0.165518 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2679  hypothetical protein  25 
 
 		 420 aa  48.9  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.794848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2312  hypothetical protein  22.45 
 
 		 426 aa  48.9  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.951883 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2432  hypothetical protein  23.74 
 
 		 425 aa  45.8  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323956  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>